RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM54Q9BYV2 358 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 CLDND1Q9NY35 253 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 POMPQ9Y244 141 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 QSOX1O00391 747 aa22.27■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ATG13O75143 517 aa22.27■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 HIST1H2ADP20671 130 aa22.27■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 GPR1P46091 355 aa22.27■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 PREPP48147 710 aa22.27■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 OGFOD2Q6N063 350 aa22.27■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa22.27■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.27■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.27■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 C9JVG2 144 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 EPB42P16452 691 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CDKL1Q00532 357 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ABRAXAS2Q15018 415 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SYTL3Q4VX76 610 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 KCNV2Q8TDN2 545 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A23Q9BV35 468 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 HDAC8Q9BY41 377 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 FADS3Q9Y5Q0 445 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 GPR45Q9Y5Y3 372 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 LRRK1Q38SD2 2015 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ANP32DO95626 131 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 IDO1P14902 403 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 GNAZP19086 355 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 EPORP19235 508 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 HMOX2P30519 316 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 GGT5P36269 586 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 PIK3CGP48736 1102 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 GALK1P51570 392 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ABRQ12979 859 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SP140Q13342 867 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 LRP8Q14114 963 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CDKL4Q5MAI5 379 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 NEK10Q6ZWH5 1172 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF765Q7L2R6 523 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA19Q7Z5L4 167 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CCT7Q99832 543 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CCM2Q9BSQ5 444 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf50Q9BV19 199 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 PFDN4Q9NQP4 134 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 RIC8BQ9NVN3 520 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 RNF11Q9Y3C5 154 aa22.26■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 FFAR3O14843 346 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SLC16A5O15375 505 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 GPR42O15529 346 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CYP2A7P20853 494 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 DRD3P35462 400 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SEC13P55735 322 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 RPS6KA2Q15349 733 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC6Q16204 474 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 GSTA3Q16772 222 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 C6orf136Q5SQH8 315 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 NLRP8Q86W28 1048 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 TDHQ8IZJ6 230 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SFRP1Q8N474 314 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 FOXJ1Q92949 421 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 PYCR2Q96C36 320 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SLC32A1Q9H598 525 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 NDE1Q9NXR1 346 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 MID1O15344 667 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 NRP2O60462 931 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 AADATQ8N5Z0 425 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM159Q96B96 161 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 NTMT1Q9BV86 223 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 OR2AG1Q9H205 316 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 AIG1Q9NVV5 245 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 EYSQ5T1H1 3165 aa22.25■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SLC5A10A0PJK1 596 aa22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 NR5A2O00482 541 aa22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 MATN4O95460 622 aa22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 LTBRP36941 435 aa22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 THOP1P52888 689 aa22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 DPTQ07507 201 aa22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ENPP2Q13822 863 aa22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CCNIQ14094 377 aa22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 PIGGQ5H8A4 983 aa22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 FAM46CQ5VWP2 391 aa22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 RASGRP3Q8IV61 690 aa22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 RNF148Q8N7C7 305 aa22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 FNDC5Q8NAU1 212 aa22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 MCOLN3Q8TDD5 553 aa22.24■■□□□ 1.15
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