RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 ARL15Q9NXU5 204 aa23.49■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 PCDHGB4Q9UN71 923 aa23.49■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa23.49■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 WASH3PC4AMC7 463 aa23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 ARNTLO00327 626 aa23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 VARSP26640 1264 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 AOAHP28039 575 aa23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 OXTRP30559 389 aa23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 PEX19P40855 299 aa23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 GJA8P48165 433 aa23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 CREB5Q02930 508 aa23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 GK3PQ14409 553 aa23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 ADIPOR2Q86V24 386 aa23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 HID1Q8IV36 788 aa23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 OR2A12Q8NGT7 310 aa23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 SLC29A3Q9BZD2 475 aa23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 CD84Q9UIB8 345 aa23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 INSL6Q9Y581 213 aa23.48■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 LOC730098B7Z3J9 87 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 MANBAO00462 879 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 ULK1O75385 1050 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 FAM58BPP0C7Q3 252 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 PTPN2P17706 415 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 PSMC3P17980 439 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 RPIAP49247 311 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 MYBPC1Q00872 1141 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 BRAT1Q6PJG6 821 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 SLC29A1Q99808 456 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 PDE10AQ9Y233 779 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 INPP4BO15327 924 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 RHOP08100 348 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 AKT1P31749 480 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 GBX1Q14549 363 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 CYP51A1Q16850 503 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 IMPG1Q17R60 797 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 TTC23LQ6PF05 361 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 DET1Q7L5Y6 550 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 TRIM46Q7Z4K8 759 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 HOMEZQ8IX15 550 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 ZBTB18Q99592 522 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 SPATA16Q9BXB7 569 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF696Q9H7X3 374 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 TCRBV5S2A0A599 114 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 C8GP07360 202 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 NCK1P16333 377 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF30P17039 623 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 HTR1EP28566 365 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 PRKCQQ04759 706 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF77Q15935 545 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 SLC5A9Q2M3M2 681 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 LY6G5CQ5SRR4 150 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 DLEU7Q6UYE1 221 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 LINC00597Q9H2U6 94 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D14Q9P2M4 693 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 NUAK1O60285 661 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 CKMT2P17540 419 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 FASP25445 335 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 DGKQP52824 942 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 HMGCS1Q01581 520 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 HSPA14Q0VDF9 509 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 SGO1Q5FBB7 561 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 PPP4R4Q6NUP7 873 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 GALNT13Q8IUC8 556 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 PLPP6Q8IY26 295 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 TCAIMQ8N3R3 496 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 USP7Q93009 1102 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 SLC32A1Q9H598 525 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 SMOXQ9NWM0 555 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 ERVW-1Q9UQF0 538 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 LZTS1Q9Y250 596 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM54-201ENST00000296098 SAC3D1A6NKF1 404 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 CLDN9O95484 217 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 FCGR1AP12314 374 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 VIPR1P32241 457 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 CTNNB1P35222 781 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 GGT5P36269 586 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 GNPDA1P46926 289 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 PWP1Q13610 501 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 FXNQ16595 210 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 CACHD1Q5VU97 1274 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 ISLR2Q6UXK2 745 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 PACRGLQ8N7B6 248 aa23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms