RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 YDJCA8MPS7 323 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 ARFRP1Q13795 201 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 TMEM125Q96AQ2 219 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 SEMA5AQ13591 1074 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 NOMO1Q15155 1222 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 DPY19L1Q2PZI1 675 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 FRMD7Q6ZUT3 714 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 KCTD13Q8WZ19 329 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 GPR21Q99679 349 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 TTLL8A6PVC2 850 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 ACSL1P33121 698 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 ITGA7Q13683 1181 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 SCIMPQ6UWF3 145 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 CEP97Q8IW35 865 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 OR10H4Q8NGA5 316 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 AGAP2Q99490 1192 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 LGMNQ99538 433 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 MRIQ9BWK5 157 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 ARL8BQ9NVJ2 186 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 GNAZP19086 355 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 MAP3K8P41279 467 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.946e-7■■□□□ 13.5
CUX1-201ENST00000292535 OR6K6Q8NGW6 343 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 MKL1Q969V6 931 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 FAM210AQ96ND0 272 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 OR2AT4A6NND4 320 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 TRAPPC6AO75865 159 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 AP2A1O95782 977 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 HEPACAMQ14CZ8 416 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 DLG2Q15700 870 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 NIPAL1Q6NVV3 410 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 ZNF613Q6PF04 617 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 USP30Q70CQ3 517 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 TREML1Q86YW5 311 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 HTRA1Q92743 480 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 HPS1Q92902 700 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 CSPG4P5Q96PW8 444 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 HEPHQ9BQS7 1158 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 A0A1W2PQH9 124 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 BUD23O43709 281 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 RCBTB2O95199 551 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 FAM47BQ8NA70 645 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 WDR18Q9BV38 432 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 CNTNAP1P78357 1384 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 A0A1B0GVM2 712 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 TCAF2A6NFQ2 919 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 CLDN25C9JDP6 229 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 PRAMEF1O95521 474 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 CFIP05156 583 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 PIRTP0C851 137 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 MPIP34949 423 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 GDAP2Q9NXN4 497 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 SCN3AQ9NY46 2000 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 MEIS2O14770 477 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 GJA1P17302 382 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 TIE1P35590 1138 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 GDI2P50395 445 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 CHADLQ6NUI6 762 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 DEFB118Q96PH6 123 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 GPR20Q99678 358 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 A0A1W2PQY0 241 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 TMEM150BA6NC51 233 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 FABP12A6NFH5 140 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 NEMP2A6NFY4 417 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 NDUFS1P28331 727 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 PBX3P40426 434 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 ACTR1BP42025 376 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 SLC30A6Q6NXT4 461 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 SLC29A4Q7RTT9 530 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 ART5Q96L15 291 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 EHD1Q9H4M9 534 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CUX1-201ENST00000292535 TRMUO75648 421 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms