RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMARCD3Q6STE5 483 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRPV3Q8NET8 790 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 PYCR2Q96C36 320 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM39AQ9NV64 488 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZW10O43264 779 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 NIPSNAP2O75323 286 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 TFPTP0C1Z6 253 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 AMD1P17707 334 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC35G1Q2M3R5 365 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 AGMOQ6ZNB7 445 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 GRPEL2Q8TAA5 225 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 PIGUQ9H490 435 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 ACSL4O60488 711 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 CYP11A1P05108 521 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 CDH1P12830 882 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 SCAMP5Q8TAC9 235 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 PLEKHO2Q8TD55 490 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 ANKRA2Q9H9E1 313 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 GIMAP2Q9UG22 337 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 DPP7Q9UHL4 492 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 BAIAP2Q9UQB8 552 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 PSAT1Q9Y617 370 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 DISP2A7MBM2 1401 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 DGKEP52429 567 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 RAB15P59190 212 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 MPPE1Q53F39 396 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 EPGNQ6UW88 154 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 RTL4Q6ZR62 310 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC22A16Q86VW1 577 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR8H3Q8N146 312 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZMIZ2Q8NF64 920 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM203Q969S6 136 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF558Q96NG5 402 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 CGREF1Q99674 301 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 TYROBPO43914 113 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 KERAO60938 352 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 ESR1P03372 595 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 RYKP34925 604 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 DUSP28Q4G0W2 176 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 LRRC15Q8TF66 581 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 AIF1LQ9BQI0 150 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 CHIAQ9BZP6 476 aa13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC25A12O75746 678 aa13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 DIRAS1O95057 198 aa13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 C22orf31O95567 290 aa13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRKACGP22612 351 aa13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 POMZP3Q6PJE2 187 aa13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 LRRC20Q8TCA0 184 aa13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 KLRG1Q96E93 195 aa13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 DSN1Q9H410 356 aa13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZBTB26Q9HCK0 441 aa13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 SOHLH2Q9NX45 425 aa13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 OR6C75A6NL08 312 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 HOXD13P35453 343 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 MAPK12P53778 367 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 RGS1Q08116 209 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC2A7Q6PXP3 512 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 PJA1Q8NG27 643 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 SNX33Q8WV41 574 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF354BQ96LW1 612 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 KCNC2Q96PR1 638 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 PTPN18Q99952 460 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 GAL3ST1Q99999 423 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 PMM2O15305 246 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 OPN1SWP03999 348 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 ITPKBP27987 946 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 TOMM20Q15388 145 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 MBLAC2Q68D91 279 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 OAFQ86UD1 273 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 PIM3Q86V86 326 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 OSER1Q9NX31 292 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 MYOM1P52179 1685 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 MPZL2O60487 215 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 CLPXO76031 633 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 DCDC1P59894 354 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 DSC3Q14574 896 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 PCLAFQ15004 111 aa13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRPM4Q8TD43 1214 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms