RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53B-201ENST00000280780 UBXN10Q96LJ8 280 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 TIMM29Q9BSF4 260 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 TSSK1BQ9BXA7 367 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 VPS11Q9H270 941 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 COG4Q9H9E3 785 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 KCNK6Q9Y257 313 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 CACNA1AO00555 2505 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 ANKRD12Q6UB98 2062 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 F8W8V4 182 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 PIAS2O75928 621 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 RASGRP1O95267 797 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 NME1P15531 152 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 DMPKQ09013 629 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 HSPA14Q0VDF9 509 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 INSCQ1MX18 579 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 CFAP206Q8IYR0 622 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 HM13Q8TCT9 377 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 CCDC134Q9H6E4 229 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 KLC4Q9NSK0 619 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 KLHL42Q9P2K6 505 aa21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 MPOP05164 745 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 JUNDP17535 347 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 PDHA2P29803 388 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 CTBSQ01459 385 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 C1orf61Q13536 156 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 UGT3A1Q6NUS8 523 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 NRROSQ86YC3 692 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 EID2Q8N6I1 236 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 KCTD4Q8WVF5 259 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 APOPT1Q96IL0 206 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 KCNK9Q9NPC2 374 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 IGSF5Q9NSI5 407 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF358Q9NW07 568 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 IKZF3Q9UKT9 509 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 ACOT9Q9Y305 439 aa21.86■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 TM9SF1O15321 606 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 SLCO2B1O94956 709 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 ZWINTO95229 277 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 TNFP01375 233 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 GSTM1P09488 218 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 AK4P27144 223 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 GNGT1P63211 74 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 GSTM4Q03013 218 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 ASZ1Q8WWH4 475 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 LINGO1Q96FE5 620 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 LRRC61Q9BV99 259 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 TLK1Q9UKI8 766 aa21.85■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 A0A087X1B8 175 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 TRIM38O00635 465 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 FLRT2O43155 660 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 APOA4P06727 396 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 CCDC166P0CW27 439 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 CEACAM1P13688 526 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 LSP1P33241 339 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 METRNLQ641Q3 311 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 GPR78Q96P69 363 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 SLC13A1Q9BZW2 595 aa21.84■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 KPNA5O15131 536 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 SPAG7O75391 227 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 MYF5P13349 255 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 CSHL1Q14406 222 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 SYTL3Q4VX76 610 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 CYHR1Q6ZMK1 362 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 SLC22A15Q8IZD6 547 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 GPBAR1Q8TDU6 330 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 GLMNQ92990 594 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 NXNL1Q96CM4 212 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 OR52A5Q9H2C5 316 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 SYTL2Q9HCH5 934 aa21.83■■□□□ 1.09
FAM53B-201ENST00000280780 YKT6O15498 198 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM53B-201ENST00000280780 EML2O95834 649 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM53B-201ENST00000280780 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
FAM53B-201ENST00000280780 GRK6P43250 576 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM53B-201ENST00000280780 IL2P60568 153 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM53B-201ENST00000280780 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
FAM53B-201ENST00000280780 LRP8Q14114 963 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM53B-201ENST00000280780 TTLL9Q3SXZ7 439 aa21.82■■□□□ 1.08
FAM53B-201ENST00000280780 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms