RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 RGS14O43566 566 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 PCSK2P16519 638 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 HTR6P50406 440 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 NME5P56597 212 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 RHDQ02161 417 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 PRKG2Q13237 762 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 TRIP10Q15642 601 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 DUSP6Q16828 381 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 GGTA1PQ4G0N0 100 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 TRIM46Q7Z4K8 759 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 RASGRP3Q8IV61 690 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 BTN2A2Q8WVV5 523 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 ASZ1Q8WWH4 475 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 SMARCD2Q92925 531 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 SCAMP4Q969E2 229 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 ARL15Q9NXU5 204 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 CCL27Q9Y4X3 112 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 FXYD1O00168 92 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 CYP2A7P20853 494 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 ETV3P41162 512 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 MAPK9P45984 424 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 HSPA14Q0VDF9 509 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 BNIP2Q12982 314 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 ADGRE1Q14246 886 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 NR6A1Q15406 480 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 ANO7Q6IWH7 933 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 SCIMPQ6UWF3 145 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 LAYNQ6UX15 382 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 C12orf40Q86WS4 652 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 GOLM1Q8NBJ4 401 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 TMIEQ8NEW7 156 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 LRRC58Q96CX6 371 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 MUC13Q9H3R2 512 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC154A6NI56 674 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 CAPNS1P04632 268 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 ABRAXAS2Q15018 415 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 LIPIQ6XZB0 460 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 CYP2U1Q7Z449 544 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 SPATA24Q86W54 205 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 ZFAND4Q86XD8 727 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 ZUFSPQ96AP4 578 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 LRGUKQ96M69 825 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 ASIC5Q9NY37 505 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 SGTAO43765 313 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 ULK1O75385 1050 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 SLCO2B1O94956 709 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 ELFN1P0C7U0 828 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 VIPR2P41587 438 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 UFM1P61960 85 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 KCNC3Q14003 757 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 AP5B1Q2VPB7 878 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 ARPINQ7Z6K5 226 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 FAM156AQ8NDB6 213 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 PROKR1Q8TCW9 393 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 USP7Q93009 1102 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 BTBD9Q96Q07 612 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 ABCG8Q9H221 673 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 GDE1Q9NZC3 331 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 DEC1Q9P2X7 70 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 RIMS3Q9UJD0 308 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD9-201ENST00000249499 MYO7AQ13402 2215 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 CLDN9O95484 217 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 JAK1P23458 1154 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 SLC6A2P23975 617 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 ITGB7P26010 798 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 PEX2P28328 305 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 GDF5P43026 501 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 SLC6A12P48065 614 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 PDGFRLQ15198 375 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 DET1Q7L5Y6 550 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 DPP10Q8N608 796 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 ADCY4Q8NFM4 1077 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 MCOLN3Q8TDD5 553 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD9-201ENST00000249499 GLYATL1Q969I3 302 aa22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms