RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 TRAM1L1Q8N609 369 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 TEX26Q8N6G2 289 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 CCHCR1Q8TD31 782 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 NRGNQ92686 78 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 NACC2Q96BF6 587 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 NDC1Q9BTX1 674 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 ETNK2Q9NVF9 386 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 SEC14L3Q9UDX4 400 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 NDOR1Q9UHB4 597 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 SLC24A2Q9UI40 661 aa15.88■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 TINAGQ9UJW2 476 aa15.88■□□□□ 0.13
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SPCS1-201ENST00000233025 SLC19A2O60779 497 aa15.87■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL18O94889 574 aa15.87■□□□□ 0.13
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SPCS1-201ENST00000233025 LINC00696Q6ZRV3 163 aa15.87■□□□□ 0.13
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SPCS1-201ENST00000233025 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa15.87■□□□□ 0.13
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SPCS1-201ENST00000233025 TNFSF10P50591 281 aa15.85■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
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SPCS1-201ENST00000233025 ZFPM2Q8WW38 1151 aa15.85■□□□□ 0.13
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SPCS1-201ENST00000233025 NFE2L1Q14494 772 aa15.84■□□□□ 0.13
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SPCS1-201ENST00000233025 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.13
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SPCS1-201ENST00000233025 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 BPIFA3Q9BQP9 254 aa15.84■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 HAUS4Q9H6D7 363 aa15.84■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 SLC22A11Q9NSA0 550 aa15.84■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 AIPL1Q9NZN9 384 aa15.84■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 MEMO1Q9Y316 297 aa15.84■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa15.84■□□□□ 0.13
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.83■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 MATN2O00339 956 aa15.83■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 CRYABP02511 175 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
SPCS1-201ENST00000233025 FTLP02792 175 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
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