RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638091.1

CACNB4-273, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 4,061 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-273	ENST00000638091	SPINT3	P49223	89 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	PGD	P52209	483 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	SMS	P52788	366 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	DR1	Q01658	176 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	FZD2	Q14332	565 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	NEPRO	Q6NW34	567 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091		Q6ZS52	159 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	MCEE	Q96PE7	176 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	COPS8	Q99627	209 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	SERTM1	A2A2V5	107 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	KRT16	P08779	473 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	KDELR1	P24390	212 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	PBX1	P40424	430 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	CDK3	Q00526	305 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	OCRL	Q01968	901 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	IRF4	Q15306	451 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	OR2L2	Q8NH16	312 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	EDEM1	Q92611	657 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	SLC6A18	Q96N87	628 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	OR10A4	Q9H209	315 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091		A0A0J9YY10	115 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091		E7EVH7	732 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	NDUFB5	O43674	189 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	BRINP1	O60477	761 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	THRA	P10827	490 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	MIP	P30301	263 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	PHB	P35232	272 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	SSPN	Q14714	243 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	CYTH1	Q15438	398 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	EID2	Q8N6I1	236 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	RAB17	Q9H0T7	212 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	CENPH	Q9H3R5	247 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	PARVB	Q9HBI1	364 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	PIGV	Q9NUD9	493 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	EMC3	Q9P0I2	261 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	EP400	Q96L91	3159 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	PFDN1	O60925	122 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	TCN2	P20062	427 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-273	ENST00000638091	GRK2	P25098	689 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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