RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC28A1O00337 649 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 E2F3O00716 465 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 NME4O00746 187 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 RGS14O43566 566 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 SNAP91O60641 907 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 FKTNO75072 461 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 BAIAP3O94812 1187 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 OLFM2O95897 454 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 PRSS56P0CW18 603 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 SMIM18P0DKX4 95 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 CBSLP0DN79 551 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP6V1B2P21281 511 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 WEE1P30291 646 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 CBSP35520 551 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 SPAM1P38567 509 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 CLCN7P51798 805 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 NR1H2P55055 460 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 NME5P56597 212 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 CAP1Q01518 475 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 CREB5Q02930 508 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 EMX2Q04743 252 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 GTF2H2Q13888 395 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 TGFBIQ15582 683 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 TMTC4Q5T4D3 741 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 C6orf52Q5T4I8 152 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXB2Q5VYV0 432 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 SULT1C3Q6IMI6 304 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP2R1Q6VVX0 501 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 FKBP9P1Q75LS8 142 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 SERPINA9Q86WD7 417 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFAND4Q86XD8 727 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC39A11Q8N1S5 342 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 TCAIMQ8N3R3 496 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 CPXM2Q8N436 756 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB2Q8N680 514 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 NAT14Q8WUY8 206 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 LRTOMTQ8WZ04 291 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 NCSTNQ92542 709 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 HTATIP2Q9BUP3 242 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC29A3Q9BZD2 475 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 TUBB1Q9H4B7 451 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 IL1RL2Q9HB29 575 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 BPIFA1Q9NP55 256 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 GKN1Q9NS71 199 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 SPG21Q9NZD8 308 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 AURKCQ9UQB9 309 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 DMTF1Q9Y222 760 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 OARD1Q9Y530 152 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 ACTL7AQ9Y615 435 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 COL4A6Q14031 1691 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 GBF1Q92538 1859 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC3P53804 2025 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 ENO4A6NNW6 628 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 FXYD1O00168 92 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 GNB5O14775 395 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 ARPC2O15144 300 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 FFAR2O15552 330 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 OR1I1O60431 355 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 EFCAB14O75071 495 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 TULP3O75386 442 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 KATNA1O75449 491 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 OR4F21O95013 312 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBC1P01850 177 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 ARSAP15289 507 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 HDCP19113 662 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC6A2P23975 617 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 NFKBIAP25963 317 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 ACRV1P26436 265 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-222ENST00000592408 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms