RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 CLDN2P57739 230 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-206ENST00000588815 HERVK_113P63132 956 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-206ENST00000588815 CDKL1Q00532 357 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-206ENST00000588815 RASGRP3Q8IV61 690 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-206ENST00000588815 VRK3Q8IV63 474 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP206Q8IYR0 622 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-206ENST00000588815 PDPRQ8NCN5 879 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP4R1Q8TF05 950 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-206ENST00000588815 EXT2Q93063 718 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR92Q96MX6 357 aa30.4■■■□□ 2.46
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CAPNS1-206ENST00000588815 ERVK-6Q9BXR3 956 aa30.4■■■□□ 2.46
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CAPNS1-206ENST00000588815 EBF2Q9HAK2 575 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-206ENST00000588815 CD274Q9NZQ7 290 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL12A8MUP2 240 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BM21 787 aa30.39■■■□□ 2.46
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CAPNS1-206ENST00000588815 TGDSO95455 350 aa30.39■■■□□ 2.46
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CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP157Q5JU67 520 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-206ENST00000588815 OR56A4Q8NGH8 313 aa30.39■■■□□ 2.46
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CAPNS1-206ENST00000588815 TRMOQ9BU70 441 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-206ENST00000588815 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-206ENST00000588815 PARVBQ9HBI1 364 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa30.39■■■□□ 2.46
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CAPNS1-206ENST00000588815 CYP2A7P20853 494 aa30.38■■■□□ 2.45
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CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 GALNT13Q8IUC8 556 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 CRLF3Q8IUI8 442 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
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CAPNS1-206ENST00000588815 PTK2BQ14289 1009 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 PYCR3Q53H96 274 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF678Q5SXM1 525 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 CES4AQ5XG92 561 aa30.38■■■□□ 2.45
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CAPNS1-206ENST00000588815 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP4F12Q9HCS2 524 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
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CAPNS1-206ENST00000588815 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
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CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H2ADP20671 130 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 HK3P52790 923 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 SETDB1Q15047 1291 aa30.37■■■□□ 2.45
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CAPNS1-206ENST00000588815 FRMD1Q8N878 549 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 MCOLN3Q8TDD5 553 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
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CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H2AJQ99878 128 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 H2AFJQ9BTM1 129 aa30.37■■■□□ 2.45
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CAPNS1-206ENST00000588815 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
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CAPNS1-206ENST00000588815 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 ORAI3Q9BRQ5 295 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR27Q9NS67 375 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-206ENST00000588815 PDE10AQ9Y233 779 aa30.35■■■□□ 2.45
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