RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 FIBINQ8TAL6 211 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 PIH1D2Q8WWB5 315 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 CDRT15Q96T59 188 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 APPL1Q9UKG1 709 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 SH3BP2P78314 561 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 CLCQ05315 142 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 PFKFB4Q16877 469 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 OGFOD2Q6N063 350 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 CHPFQ8IZ52 775 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 ROPN1LQ96C74 230 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 NUDT4Q9NZJ9 180 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 LAMA1P25391 3075 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-204ENST00000587718 SUPT3HB4E1H0 165 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 SUPT3HO75486 399 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 MATN4O95460 622 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 BAG2O95816 211 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 TSPAN12O95859 305 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 LRP8Q14114 963 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 CTSL3PQ5NE16 218 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA1211LQ6NV74 962 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 CYHR1Q6ZMK1 362 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA19Q7Z5L4 167 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 PIANPQ8IYJ0 282 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 PGBD3Q8N328 593 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 CD200R1Q8TD46 325 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 SPACA7Q96KW9 195 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 ECSITQ9BQ95 431 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR63Q9BZJ6 419 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 MID1IP1Q9NPA3 183 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCB8Q9NUT2 735 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 DHRS7Q9Y394 339 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 LNP1A1A4G5 178 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 LINGO4Q6UY18 593 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 LPCAT2Q7L5N7 544 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP2U1Q7Z449 544 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 CATSPER1Q8NEC5 780 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 TWIST2Q8WVJ9 160 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 PATE3B3GLJ2 98 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 IGSF6O95976 241 aa25■■□□□ 1.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 THOP1P52888 689 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 PKNOX1P55347 436 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 PSME3P61289 254 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 BCL2L1Q07817 233 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR33Q49SQ1 333 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 AGKQ53H12 422 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 PRMT9Q6P2P2 845 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEFF1Q8IYR6 380 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 PNPLA1Q8N8W4 532 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 EDEM2Q9BV94 578 aa25■■□□□ 1.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL42Q9P2K6 505 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 CLEC4EQ9ULY5 219 aa25■■□□□ 1.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa24.99■■□□□ 1.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PQ67 120 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 WASH3PC4AMC7 463 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP3K13O43283 966 aa24.99■■□□□ 1.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 LBPP18428 481 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 SDE2Q6IQ49 451 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 OR56A4Q8NGH8 313 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 HMGCLL1Q8TB92 370 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 PYDC1Q8WXC3 89 aa24.99■■□□□ 1.59
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