RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF789Q5FWF6 425 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 PITRM1Q5JRX3 1037 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 PAGE3Q5JUK9 113 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM92BQ6ZTR7 304 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 USP43Q70EL4 1123 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 SERPINA11Q86U17 422 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 CALHM3Q86XJ0 350 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 PLD3Q8IV08 490 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXO22Q8NEZ5 403 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 SETD6Q8TBK2 473 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJB3Q8WWF6 145 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 RASSF5Q8WWW0 418 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 TANKQ92844 425 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 MYDGFQ969H8 173 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC35B4Q969S0 331 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 TESCQ96BS2 214 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 YIPF6Q96EC8 236 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 HMCESQ96FZ2 354 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 PYURFQ96I23 114 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF583Q96ND8 569 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 MBOAT4Q96T53 435 aa7.6□□□□□ -1.19
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CAPNS1-202ENST00000586851 PITX2Q99697 317 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 CTRCQ99895 268 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 SEMA3CQ99985 751 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 NTMT1Q9BV86 223 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 DPY30Q9C005 99 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 RDH14Q9HBH5 336 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 C1orf109Q9NX04 203 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 IL37Q9NZH6 218 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 GJD2Q9UKL4 321 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 INVSQ9Y283 1065 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 CRYL1Q9Y2S2 319 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 IFT52Q9Y366 437 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.6□□□□□ -1.19
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CAPNS1-202ENST00000586851 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.6□□□□□ -1.19
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CAPNS1-202ENST00000586851 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 ARL5CA6NH57 179 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 CENPBD1B2RD01 187 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 H0Y858 1186 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 RGS13O14921 159 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 PER2O15055 1255 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD28O15084 1053 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 NUAK1O60285 661 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 MPZL2O60487 215 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 CREG1O75629 220 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 MED26O95402 600 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 SEC24AO95486 1093 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 DGKAP23743 735 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 HTR1BP28222 390 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 ELK4P28324 431 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 SHMT2P34897 504 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 CASP2P42575 452 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 GJA8P48165 433 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNC1P48547 511 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 ARSDP51689 593 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 CLCNKBP51801 687 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 FKBP1BP68106 108 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 DSC2Q02487 901 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 GNA12Q03113 381 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 CACNG1Q06432 222 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC10A7Q0GE19 358 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 CDK5R2Q13319 367 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 VEZF1Q14119 521 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 TSNQ15631 228 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-202ENST00000586851 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.59□□□□□ -1.19
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