RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A096LPK6	155 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ARL5C	A6NH57	179 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PTGES	O14684	152 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PPEF2	O14830	753 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PFDN6	O15212	129 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SEPT4	O43236	478 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TM7SF2	O76062	418 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	B3GAT3	O94766	335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	OAZ2	O95190	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	EPO	P01588	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RBP1	P09455	135 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TPBGL	P0DKB5	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CSH1	P0DML2	217 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CSH2	P0DML3	217 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GNAZ	P19086	355 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	HOXD10	P28358	340 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGEA11	P43364	429 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGEA12	P43365	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	COPA	P53621	1224 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	OVGP1	Q12889	678 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	E2F5	Q15329	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TAF11	Q15544	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GSTA3	Q16772	222 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KLC3	Q6P597	504 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	BBS5	Q8N3I7	341 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	URGCP	Q8TCY9	931 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GAD1	Q99259	594 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	IL12RB2	Q99665	862 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SMO	Q99835	787 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-215	ENST00000583289	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRM-215	ENST00000583289	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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