RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577721.5

SMARCE1-212, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 449 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-212ENST00000577721 CBX6O95503 412 aa6.69□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 BPIP17213 487 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 NFKB1P19838 968 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 OTX2P32243 289 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 DCDC1P59894 354 aa6.69□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 XRCC4Q13426 336 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 DPYSL3Q14195 570 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 NFKBIBQ15653 356 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.69□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.69□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.69□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 OOSP2Q86WS3 158 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 MAP7D3Q8IWC1 876 aa6.69□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.69□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 EID2BQ96D98 161 aa6.69□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 CD180Q99467 661 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 SYT11Q9BT88 431 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 NLNQ9BYT8 704 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 GSX2Q9BZM3 304 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.69□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 ZNF711Q9Y462 761 aa6.69□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 ARHGAP10A1A4S6 786 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 OR5K3A6NET4 321 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 WIPF3A6NGB9 483 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 TLCD2A6NGC4 264 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 DBX1A6NMT0 343 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 PEX12O00623 359 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 CEACAM4O75871 244 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 LCA5LO95447 670 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 ALPPP05187 535 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 MMP2P08253 660 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 AGXTP21549 392 aa6.68□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 PRKAA1Q13131 559 aa6.68□□□□□ -1.34
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SMARCE1-212ENST00000577721 PPP2R5EQ16537 467 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 MLIPQ5VWP3 458 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 RAB43Q86YS6 212 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 DSELQ8IZU8 1212 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 ZBTB2Q8N680 514 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCE1-212ENST00000577721 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.68□□□□□ -1.34
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