RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	EID2B	Q96D98	161 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF583	Q96ND8	569 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	EGFL8	Q99944	293 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	CD244	Q9BZW8	370 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	RNF38	Q9H0F5	515 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	RNF186	Q9NXI6	227 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	EBF1	Q9UH73	591 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	GMEB1	Q9Y692	573 aa		18.09	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ARVCF	O00192	962 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	GPR39	O43194	453 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ULK1	O75385	1050 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ALPL	P05186	524 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	CTPS1	P17812	591 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	MAPK8	P45983	427 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	EMP3	P54852	163 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	NFATC2	Q13469	925 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	SELPLG	Q14242	412 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	TMBIM1	Q969X1	311 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	HBEGF	Q99075	208 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ASB8	Q9H765	288 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	ASIC5	Q9NY37	505 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	WWOX	Q9NZC7	414 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	VPS51	Q9UID3	782 aa		18.08	■□□□□ 0.49
RRN3-205	ENST00000563559	UPK1A	O00322	258 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TAPBP	O15533	448 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	GUCA1C	O95843	209 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	THRB	P10828	461 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	GNPDA1	P46926	289 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PIK3CG	P48736	1102 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PMS2P3	Q13401	168 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	RAB39A	Q14964	217 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PYCR3	Q53H96	274 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB2	Q8N680	514 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	NTMT1	Q9BV86	223 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	DPY30	Q9C005	99 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	RDH14	Q9HBH5	336 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0U1RQS6	177 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF15	O94989	841 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PRAMEF12	O95522	483 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ALPI	P09923	528 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	EBLN1	P0CF75	366 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	MTHFR	P42898	656 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	GPR33	Q49SQ1	333 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TTC23	Q5W5X9	447 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF773	Q6PK81	442 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	GTF2H4	Q92759	462 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ING2	Q9H160	280 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	GALNT8	Q9NY28	637 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	VAPA	Q9P0L0	249 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559		K7EPI3	171 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	SCEL	O95171	688 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ACRV1	P26436	265 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CYP4F3	Q08477	520 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CDH18	Q13634	790 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	VEPH1	Q14D04	833 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PLCL1	Q15111	1095 aa		18.07	■□□□□ 0.48

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