RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558960.1

ADAMTS17-205, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 2

Gene ADAMTS17, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-205ENST00000558960 SEMA6CQ9H3T2 930 aa20.52■□□□□ 0.88
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ADAMTS17-205ENST00000558960 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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ADAMTS17-205ENST00000558960 PLD2O14939 933 aa20.51■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 KDM1AO60341 852 aa20.51■□□□□ 0.87
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ADAMTS17-205ENST00000558960 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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ADAMTS17-205ENST00000558960 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP20.5■□□□□ 0.87
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ADAMTS17-205ENST00000558960 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.5■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 LPGAT1Q92604 370 aa20.5■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 CCDC74BQ96LY2 380 aa20.5■□□□□ 0.87
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ADAMTS17-205ENST00000558960 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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ADAMTS17-205ENST00000558960 ITGB6P18564 788 aa20.49■□□□□ 0.87
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ADAMTS17-205ENST00000558960 POLG2Q9UHN1 485 aa20.49■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.49■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 ASF1AQ9Y294 204 aa20.49■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 CRYL1Q9Y2S2 319 aa20.49■□□□□ 0.87
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ADAMTS17-205ENST00000558960 TNFSF15O95150 251 aa20.48■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 S1PR4O95977 384 aa20.48■□□□□ 0.87
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ADAMTS17-205ENST00000558960 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa20.48■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 ARMC6Q6NXE6 501 aa20.48■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 C8orf74Q6P047 294 aa20.48■□□□□ 0.87
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ADAMTS17-205ENST00000558960 BIRC8Q96P09 236 aa20.48■□□□□ 0.87
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ADAMTS17-205ENST00000558960 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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