RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	KCNJ11	Q14654	390 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SLC6A19	Q695T7	634 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	OR10G6	Q8NH81	332 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	EID2B	Q96D98	161 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	C5orf34	Q96MH7	638 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ACTL8	Q9H568	366 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	HACD3	Q9P035	362 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ZNF711	Q9Y462	761 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	AKAP9	Q99996	3911 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	NF1	P21359	2839 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	AURKA	O14965	403 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TPSB2	P20231	275 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	IVD	P26440	423 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ETV3	P41162	512 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	GRIA1	P42261	906 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	LMAN1	P49257	510 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TPSAB1	Q15661	275 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222		Q6ZVL8	140 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CPT1B	Q92523	772 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	DTD2	Q96FN9	168 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	OR6C1	Q96RD1	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TEX101	Q9BY14	249 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CD84	Q9UIB8	345 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	FAM187A	A6NFU0	413 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	HMGCL	P35914	325 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	GPLD1	P80108	840 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	CDH17	Q12864	832 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	MNS1	Q8NEH6	495 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	NUS1	Q96E22	293 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	NUDT9	Q9BW91	350 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	ING2	Q9H160	280 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	OGFR	Q9NZT2	677 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	HIVEP1	P15822	2718 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	PCSK5	Q92824	1860 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
CS-231	ENST00000552222	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	RAD51C	O43502	376 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	TMEM63A	O94886	807 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	TYRP1	P17643	537 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	TPH1	P17752	444 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SPINT3	P49223	89 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	TERF1	P54274	439 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	HHEX	Q03014	270 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	DPT	Q07507	201 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	NLRP8	Q86W28	1048 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SFRP1	Q8N474	314 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	AGAP2	Q99490	1192 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ZPBP	Q9BS86	351 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	IL17C	Q9P0M4	197 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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