RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551592.5

SENP1-208, Transcript of SUMO specific peptidase 1, human

TSL 3

Gene SENP1, Length 866 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SENP1-208	ENST00000551592	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PDE1B	Q01064	536 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	BNC1	Q01954	994 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PPAT	Q06203	517 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SMU1	Q2TAY7	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	GBP6	Q6ZN66	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	RAPH1	Q70E73	1250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	DNASE1L2	Q92874	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PIGT	Q969N2	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SNX21	Q969T3	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CSF3R	Q99062	836 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ABCC9	O60706	1549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	MID1	O15344	667 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SLC22A3	O75751	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SERPINI2	O75830	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	GCNT3	O95395	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	LDLR	P01130	860 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CD22	P20273	847 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	LHX1	P48742	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PTEN	P60484	403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	COG7	P83436	770 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TRAF3	Q13114	568 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	RABEP1	Q15276	862 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	UGCG	Q16739	394 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CDO1	Q16878	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	HOOK3	Q86VS8	718 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CABS1	Q96KC9	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	STK26	Q9P289	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	RNF150	Q9ULK6	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	LRRD1	A4D1F6	860 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	OR5K3	A6NET4	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	MEIS2	O14770	477 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF263	O14978	683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	AP5Z1	O43299	807 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CLDN14	O95500	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CSN3	P07498	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	PSG1	P11464	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	UBXN1	Q04323	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	COASY	Q13057	564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SENP1-208	ENST00000551592	NRAC	Q8N912	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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