RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 SPAM1P38567 509 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 SSR1P43307 286 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 MMRN1Q13201 1228 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 DPYSL3Q14195 570 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ASIC2Q16515 512 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 PPP2R5EQ16537 467 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 RHBDD2Q6NTF9 364 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa11.56□□□□□ -0.56
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CS-228ENST00000551473 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 NT5DC3Q86UY8 548 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 HOOK3Q86VS8 718 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ACVR1CQ8NER5 493 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 OR4E2Q8NGC2 313 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 TRIB3Q96RU7 358 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 SLX1AQ9BQ83 275 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 CCM2Q9BSQ5 444 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 WWP1Q9H0M0 922 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 NUP62CLQ9H1M0 184 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 SRMSQ9H3Y6 488 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 OLAHQ9NV23 265 aa11.56□□□□□ -0.56
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CS-228ENST00000551473 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 POLQO75417 2590 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 MGAT4DA6NG13 374 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 OR2AG2A6NM03 316 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 JRKO75564 520 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 NDST3O95803 873 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 MSH3P20585 1137 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 CAPN3P20807 821 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 SSTR2P30874 369 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 LMAN1P49257 510 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 CTSCP53634 463 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 PDK2Q15119 407 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 PCSK7Q16549 785 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 HIF1AQ16665 826 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 SPNS3Q6ZMD2 512 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 KCTD6Q8NC69 237 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 OR2L2Q8NH16 312 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 LCN9Q8WX39 176 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 CNDP1Q96KN2 507 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 PPM1MQ96MI6 270 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 HAUS4Q9H6D7 363 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 BPIFA1Q9NP55 256 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 TXLNGQ9NUQ3 528 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 FANCLQ9NW38 375 aa11.55□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 C2orf74A8MZ97 194 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 KCNK1O00180 336 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 OR2B3O76000 313 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 CD48P09326 243 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 CBSLP0DN79 551 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ST6GAL1P15907 406 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 HTR1EP28566 365 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 AKT1P31749 480 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 CBSP35520 551 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 INAQ16352 499 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 FNBP1LQ5T0N5 605 aa11.54□□□□□ -0.56
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CS-228ENST00000551473 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 MRGPRGQ86SM5 289 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ISCUQ9H1K1 167 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 SLC25A51Q9H1U9 297 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 IL26Q9NPH9 171 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 HACD3Q9P035 362 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ANAPC7Q9UJX3 599 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa11.54□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 LRRC53A6NM62 1247 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 MYO1FO00160 1098 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 MMP11P24347 488 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 PRKCIP41743 596 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ARSEP51690 589 aa11.53□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 GBE1Q04446 702 aa11.53□□□□□ -0.56
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