RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550261.5

PPP1CC-205, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 5

Gene PPP1CC, Length 747 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	CNPY3	Q9BT09	278 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	NACA2	Q9H009	215 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	POMK	Q9H5K3	350 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	SI	P14410	1827 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	MYH11	P35749	1972 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	CIT	O14578	2027 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261		E5RJQ4	531 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	FCHO1	O14526	889 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	DSCR3	O14972	297 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF263	O14978	683 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	EPHB6	O15197	1021 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	LINC01565	O15544	149 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	COCH	O43405	550 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	DCX	O43602	365 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	DAB1	O75553	588 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	BEST1	O76090	585 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	ADCY5	O95622	1261 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	APOE	P02649	317 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	CYP1A2	P05177	515 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	RARG	P13631	454 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	CHRNB2	P17787	502 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	ABCB4	P21439	1286 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	MST1	P26927	711 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	HOXA6	P31267	233 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	SDC4	P31431	198 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	HCAR3	P49019	387 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	CXCR3	P49682	368 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	CLCN5	P51795	746 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	DGKQ	P52824	942 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	STARD6	P59095	220 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	DMC1	Q14565	340 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF77	Q15935	545 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	BNIPL	Q7Z465	357 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	MYADM	Q96S97	322 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PPP1CC-205	ENST00000550261	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.26	□□□□□ -1.73

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