RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 OPTCQ9UBM4 332 aa13.76□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 SLC25A13Q9UJS0 675 aa13.76□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa13.76□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 AK5Q9Y6K8 562 aa13.76□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa13.76□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 HIDE1A8MVS5 230 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 K7EPI3 171 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 NPPAP01160 153 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 SMIM18P0DKX4 95 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 BMP2P12643 396 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 MSH3P20585 1137 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 HMOX2P30519 316 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 GK3PQ14409 553 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 GBX1Q14549 363 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 TEAD2Q15562 447 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 FXNQ16595 210 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 AP5B1Q2VPB7 878 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 NANOGP8Q6NSW7 305 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 ANKFN1Q8N957 763 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 CHST14Q8NCH0 376 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 GBP5Q96PP8 586 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 COPS8Q99627 209 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 SLC29A1Q99808 456 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 MUC13Q9H3R2 512 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 NANOGQ9H9S0 305 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 B4GALT6Q9UBX8 382 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 ZMYM5Q9UJ78 669 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 DHRS12A0PJE2 317 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 ARNTLO00327 626 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 CCR7P32248 378 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 SPINT3P49223 89 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 LIPEQ05469 1076 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 NRF1Q16656 503 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 DLEU7Q6UYE1 221 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 Q6ZVU0 165 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 ADIPOR2Q86V24 386 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 TMEM74Q96NL1 305 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 BBS2Q9BXC9 721 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 ABCG8Q9H221 673 aa13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 PLXNA2O75051 1894 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 LAMA3Q16787 3333 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 WASH3PC4AMC7 463 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 RFPL2O75678 378 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 JAK1P23458 1154 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 AOAHP28039 575 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 OXTRP30559 389 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 GJA8P48165 433 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 CLCN2P51788 898 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 MYBPC1Q00872 1141 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 CREB5Q02930 508 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 INPP5AQ14642 412 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 KIAA0040Q15053 153 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 LIN52Q52LA3 116 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 LRRC73Q5JTD7 316 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 TMEM215Q68D42 235 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 SLC2A7Q6PXP3 512 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 TRIM46Q7Z4K8 759 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 ADGRG5Q8IZF4 528 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 AHI1Q8N157 1196 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 OR2A12Q8NGT7 310 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 IRF7Q92985 503 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 PPP3R2Q96LZ3 170 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 CNBD2Q96M20 576 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 CIB1Q99828 191 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 PIDD1Q9HB75 910 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 IL23AQ9NPF7 189 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 TDP1Q9NUW8 608 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 TRPS1Q9UHF7 1281 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 RNF11Q9Y3C5 154 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 TCRBV5S2A0A599 114 aa13.73□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 WDR47O94967 919 aa13.73□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 EBLN1P0CF75 366 aa13.73□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 TYRP14679 529 aa13.73□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 EPORP19235 508 aa13.73□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 PIK3CGP48736 1102 aa13.73□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 AAK1Q2M2I8 961 aa13.73□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 SLC5A9Q2M3M2 681 aa13.73□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 SMU1Q2TAY7 513 aa13.73□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 CDKL4Q5MAI5 379 aa13.73□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 HID1Q8IV36 788 aa13.73□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 PLPP6Q8IY26 295 aa13.73□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 NUDT8Q8WV74 236 aa13.73□□□□□ -0.21
LIMK1-208ENST00000538333 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms