RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 TEPSINQ96N21 525 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 GAD1Q99259 594 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MED10Q9BTT4 135 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TKTL2Q9H0I9 626 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 EHD3Q9NZN3 535 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF112Q9UJU3 913 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 USP21Q9UK80 565 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CFL2Q9Y281 166 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MAU2Q9Y6X3 613 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MIA3Q5JRA6 1907 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ANKRD36A6QL64 1941 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MYLKQ15746 1914 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A075B6Q4 140 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 LCHNA4D1U4 455 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MROH6A6NGR9 719 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 A8MU76 341 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 C9JVG2 144 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 KLK8O60259 260 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MAFKO60675 156 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 IL6P05231 212 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 GJB1P08034 283 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MTHFD2P13995 350 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ALDH4A1P30038 563 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 HOXC13P31276 330 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TGFBR2P37173 567 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 HNF4AP41235 474 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MAGEA11P43364 429 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC15A1P46059 708 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 KCNC1P48547 511 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SCNN1GP51170 649 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CDKN2DP55273 166 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 WNT3AP56704 352 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MTPNP58546 118 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ACVR1Q04771 509 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 GALNT3Q14435 633 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SEMA3AQ14563 771 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 RBBP7Q16576 425 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SMUG1Q53HV7 270 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF789Q5FWF6 425 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ARMCX4Q5H9R4 360 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MLIPQ5VWP3 458 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF280DQ6N043 979 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM207Q6UWW9 146 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 KRT73Q86Y46 540 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SYTL1Q8IYJ3 562 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CRELD1Q96HD1 420 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PYURFQ96I23 114 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PPM1MQ96MI6 270 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 KCNA7Q96RP8 456 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF382Q96SR6 550 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ULBP1Q9BZM6 244 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CLPBQ9H078 707 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SMOC2Q9H3U7 446 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SPON1Q9HCB6 807 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MYOZ2Q9NPC6 264 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 DYRK4Q9NR20 520 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TAS2R13Q9NYV9 303 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 IL37Q9NZH6 218 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 GIMAP2Q9UG22 337 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 RNF6Q9Y252 685 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TIMM22Q9Y584 194 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 KLK4Q9Y5K2 254 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.41□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 EVPLQ92817 2033 aa7.4□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ASB14A6NK59 587 aa7.4□□□□□ -1.23
HMBOX1-211ENST00000524238 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.4□□□□□ -1.23
HMBOX1-211ENST00000524238 STX7O15400 261 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
HMBOX1-211ENST00000524238 SEC22BO75396 215 aa7.4□□□□□ -1.23
HMBOX1-211ENST00000524238 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
HMBOX1-211ENST00000524238 CREG1O75629 220 aa7.4□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms