RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RASGEF1CQ8N431 466 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NGEFQ8N5V2 710 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC5A8Q8N695 610 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF527Q8NB42 609 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MYRIPQ8NFW9 859 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR1J1Q8NGS3 322 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR14L1PQ8NHC6 308 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DNAAF4Q8WXU2 420 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HERVK_113Q902F9 699 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 STAMQ92783 540 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ELP4Q96EB1 424 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SGCZQ96LD1 299 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SEMA3CQ99985 751 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BRINP2Q9C0B6 783 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC28A3Q9HAS3 691 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NTN4Q9HB63 628 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACKR4Q9NPB9 350 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LTB4R2Q9NPC1 389 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A4GALTQ9NPC4 353 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OLFML3Q9NRN5 406 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SERINC1Q9NRX5 453 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NDE1Q9NXR1 346 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR14J1Q9UGF5 321 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GDAQ9Y2T3 454 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DERAQ9Y315 318 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF175Q9Y473 711 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.35
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A1W2PQ67 120 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR2M5A3KFT3 312 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VENTXO95231 258 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGHEP01854 428 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SELLP14151 372 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IL7RP16871 459 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ATF3P18847 181 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LHCGRP22888 699 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BTKQ06187 659 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RUNX3Q13761 415 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CAMK1Q14012 370 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC25A53Q5H9E4 307 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CES4AQ5XG92 561 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RINLQ6ZS11 566 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 POGZQ7Z3K3 1410 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF554Q86TJ5 538 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR4N5Q8IXE1 308 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ENTHD1Q8IYW4 607 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KIRREL3Q8IZU9 778 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 METTL4Q8N3J2 472 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EMC1Q8N766 993 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HM13Q8TCT9 377 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AGAP11Q8TF27 550 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SMPDL3BQ92485 455 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NSL1Q96IY1 281 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MYADMQ96S97 322 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GFI1Q99684 422 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHCHD5Q9BSY4 110 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCDC28BQ9BUN5 200 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYTL1Q9NRR1 136 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ALKBH4Q9NXW9 302 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GTSE1Q9NYZ3 720 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 COPG2Q9UBF2 871 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 Q9UF83 564 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IL17BQ9UHF5 180 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MEGF6O75095 1541 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 B9A039 149 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 E9PI62 339 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 G3V2L1 256 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLK10O43240 276 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CD5P06127 495 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CD1EP15812 388 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CA4P22748 312 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HRH2P25021 359 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CST5P28325 142 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GNAQP50148 359 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ATP4BP51164 291 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FGFBP1Q14512 234 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SHHQ15465 462 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 Q1RN00 199 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CTXN3Q4LDR2 81 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TANGO2Q6ICL3 276 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM81Q6P7N7 255 aa0.33□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms