RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 KBTBD6Q86V97 674 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 SLC44A3Q8N4M1 653 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 OR56A4Q8NGH8 313 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 CEP70Q8NHQ1 597 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 ASB12Q8WXK4 309 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 SCAMP4Q969E2 229 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 FAM131CQ96AQ9 280 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 FAM136AQ96C01 138 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 ACOX2Q99424 681 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 HIST1H2AJQ99878 128 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 CCM2Q9BSQ5 444 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 H2AFJQ9BTM1 129 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 MEAF6Q9HAF1 191 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 KCNK12Q9HB15 430 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 PARVBQ9HBI1 364 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 TCF7L2Q9NQB0 619 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 CD84Q9UIB8 345 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 CDYLQ9Y232 598 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 REV3LO60673 3130 aa7.38□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 CAPN14A8MX76 684 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 H0YHG0 523 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 GFYI3L273 518 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 MAN2B1O00754 1011 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 AZIN1O14977 448 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 GPR39O43194 453 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 KCNJ13O60928 360 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 CDK14O94921 469 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 ESRRBO95718 433 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 CHEK2O96017 543 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 DNTTP04053 509 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 ANXA5P08758 320 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 UROSP10746 265 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 EZRP15311 586 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 PCSK2P16519 638 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 CYP2A7P20853 494 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 MPSTP25325 297 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 PTPN4P29074 926 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 CCR7P32248 378 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 CA5AP35218 305 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 DRD3P35462 400 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 GGT5P36269 586 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 MAGEA9P43362 315 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 RPS14P62263 151 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 RPS21P63220 83 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 TUBB3Q13509 450 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 GTF2H3Q13889 308 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 PPP1R3AQ16821 1122 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 EOGTQ5NDL2 527 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 ASRGL1Q7L266 308 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 SFTPA1Q8IWL2 248 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 HDDC3Q8N4P3 179 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 MCOLN3Q8TDD5 553 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 UBTD2Q8WUN7 234 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 ATL1Q8WXF7 558 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 ASB11Q8WXH4 323 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 PPM1EQ8WY54 764 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 GLMNQ92990 594 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM159Q96B96 161 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 KLHL29Q96CT2 875 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 CMTM5Q96DZ9 223 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 HIC2Q96JB3 615 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 FOPNLQ96NB1 174 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF382Q96SR6 550 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 EBF4Q9BQW3 602 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 HGH1Q9BTY7 390 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 NMUR2Q9GZQ4 415 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 C1orf21Q9H246 121 aa7.37□□□□□ -1.23
SEC31A-241ENST00000515749 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms