RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OGG1O15527 345 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLPP2O43688 288 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPC4O75487 556 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TPOP07202 933 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATP1A3P13637 1013 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MSH2P43246 934 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC6A12P48065 614 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PGFP49763 221 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GALCP54803 685 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CD81P60033 236 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MS4A2Q01362 244 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TSTQ16762 297 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ALS2CLQ60I27 953 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM166AQ6J272 317 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GALNT5Q7Z7M9 940 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TICAM2Q86XR7 235 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CEP97Q8IW35 865 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OR2T12Q8NG77 320 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GSDMBQ8TAX9 411 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POMGNT1Q8WZA1 660 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC47A1Q96FL8 570 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPM1MQ96MI6 270 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SYT15Q9BQS2 421 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RHNO1Q9BSD3 238 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UNC45AQ9H3U1 944 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SIX2Q9NPC8 291 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa2.84□□□□□ -1.95
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FLT1P17948 1338 aa2.84□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 J3QR06 171 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLK4O00444 970 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CREB3O43889 395 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NADKO95544 446 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AGR2O95994 175 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HMBSP08397 361 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NFKBIAP25963 317 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EPHA2P29317 976 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRAMEP78395 509 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UBE2V1Q13404 147 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MEP1AQ16819 746 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 JADE1Q6IE81 842 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMTC3Q6ZXV5 915 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ISCA2Q86U28 154 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NGEFQ8N5V2 710 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 L3MBTL4Q8NA19 623 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LINC00167Q96N53 147 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC22A12Q96S37 553 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NCAPGQ9BPX3 1015 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RTP3Q9BQQ7 232 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MUC13Q9H3R2 512 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPR83Q9NYM4 423 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNAJB4Q9UDY4 337 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TSPYL4Q9UJ04 414 aa2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 A8MZ25 164 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NPHP1O15259 732 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GCNT3O95395 438 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 H1F0P07305 194 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZBTB25P24278 435 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 THOP1P52888 689 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MED22Q15528 200 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ALFQ53S48 1182 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KLC3Q6P597 504 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM154Q6P9G4 183 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TICAM1Q8IUC6 712 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GALNT13Q8IUC8 556 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF611Q8N823 705 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KCNG4Q8TDN1 519 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OMA1Q96E52 524 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OR2A14Q96R47 310 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SETD4Q9NVD3 440 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PTTG2Q9NZH5 202 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NENFQ9UMX5 172 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa2.82□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.81□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa2.81□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLOD2O00469 737 aa2.81□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GH2P01242 217 aa2.81□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LAMP2P13473 410 aa2.81□□□□□ -1.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CKMT2P17540 419 aa2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms