RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
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RABGEF1-211ENST00000503687 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP12.57□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 28.1
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RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-211ENST00000503687 CERS6Q6ZMG9 384 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-211ENST00000503687 ITIH5Q86UX2 942 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM110BQ8TC76 370 aa12.57□□□□□ -0.4
RABGEF1-211ENST00000503687 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
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