RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497377.5

HLA-B-254, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, human

Gene HLA-B, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HLA-B-254	ENST00000497377	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	NEPRO	Q6NW34	567 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	CES3	Q6UWW8	571 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	XKR5	Q6UX68	686 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	NAT14	Q8WUY8	206 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	ELMO1	Q92556	727 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	PANX3	Q96QZ0	392 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	CMKLR1	Q99788	373 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	PDP2	Q9P2J9	529 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	CDC23	Q9UJX2	597 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	SATB2	Q9UPW6	733 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		11.2	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	PLD2	O14939	933 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	APOA4	P06727	396 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	THRA	P10827	490 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	AMD1	P17707	334 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	CSF2RB	P32927	897 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	ITGA8	P53708	1063 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	ARL4C	P56559	192 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	PRR20E	P86478	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	PRR20C	P86479	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	PRR20D	P86480	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	PRR20B	P86481	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	PRR20A	P86496	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	CALCOCO2	Q13137	446 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	CBLB	Q13191	982 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	KRT33B	Q14525	404 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	HIF1A	Q16665	826 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	SYTL3	Q4VX76	610 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	PDZD3	Q86UT5	571 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	MDM1	Q8TC05	714 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	NCSTN	Q92542	709 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	ERP44	Q9BS26	406 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	RAB33B	Q9H082	229 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	RAB17	Q9H0T7	212 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	P2RY12	Q9H244	342 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	THSD1	Q9NS62	852 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	WHRN	Q9P202	907 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	IGF2R	P11717	2491 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		11.19	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	ACACA	Q13085	2346 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	BRINP1	O60477	761 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	C9	P02748	559 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	ESR1	P03372	595 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	MPO	P05164	745 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	ITGA2B	P08514	1039 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	JMJD7	P0C870	316 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
HLA-B-254	ENST00000497377	MAPK9	P45984	424 aa		11.18	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms