RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SGSM3	Q96HU1	749 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	FOPNL	Q96NB1	174 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	RARRES3	Q9UL19	164 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SNX12	Q9UMY4	172 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	GSAP	A4D1B5	854 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CTAGE9	A4FU28	777 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	OR5K3	A6NET4	321 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	TLCD2	A6NGC4	264 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246		H3BMM5	538 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	MLN	P12872	115 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CDH3	P22223	829 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXN2	P32314	431 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ETV5	P41161	510 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	TERF1	P54274	439 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	MC1R	Q01726	317 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKS6	Q68DC2	871 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ESX1	Q8N693	406 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PRELID2	Q8N945	189 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CALML6	Q8TD86	181 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PRORY	Q9H606	182 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF14	Q9UBS8	474 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ASF1A	Q9Y294	204 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	OR6C74	A6NCV1	312 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PRR19	A6NJB7	356 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	C2orf74	A8MZ97	194 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	C9orf172	C9J069	976 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246		E5RI56	91 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	RAD1	O60671	282 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMA3	P25788	255 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	MGAT1	P26572	445 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SHMT2	P34897	504 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	GRIA1	P42261	906 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	GFER	P55789	205 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	HSD11B2	P80365	405 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CFHR1	Q03591	330 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR150	Q8NGU9	434 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	OR8K5	Q8NH50	307 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	RSC1A1	Q92681	617 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	MS4A14	Q96JA4	679 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	OR6C1	Q96RD1	312 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	TCF12	Q99081	682 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CARD6	Q9BX69	1037 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SOX13	Q9UN79	622 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		11.04	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms