RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	NXNL1	Q96CM4	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	RMDN1	Q96DB5	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ARSG	Q96EG1	525 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	FEZF1	A0PJY2	475 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	SYNGR3	O43761	229 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	TSPAN1	O60635	241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	FMO5	P49326	533 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	TERF1	P54274	439 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	PKP4	Q99569	1192 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	OR10H2	O60403	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	C22orf31	O95567	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	HSPB3	Q12988	150 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CD101	Q93033	1021 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802		A0A1W2PPM1	405 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CAPN9	O14815	690 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	BUB3	O43684	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CTSV	O60911	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	DANCR	P0C864	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	TSPY3	P0CV98	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	TSPY8	P0CW00	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ACP2	P11117	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CKMT2	P17540	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CBL	P22681	906 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	RAB28	P51157	221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF75D	P51815	510 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	GAS1	P54826	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	TSPY1	Q01534	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	GAGE5	Q13069	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	GAGE6	Q13070	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	MFAP5	Q13361	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	PSMD6	Q15008	389 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CHST3	Q7LGC8	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKAP2-208	ENST00000495802	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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