RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
C9orf135-204ENST00000495399 CTAGE9A4FU28 777 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 C5orf60A6NFR6 353 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 ARGFXA6NJG6 315 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 RHPN2P1A8MT19 583 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 A8MX80 341 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 F5H423 210 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 INPP4BO15327 924 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 KATNA1O75449 491 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 PRLP01236 227 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 PDHA1P08559 390 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 ETS1P14921 441 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 MMP12P39900 470 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 CD86P42081 329 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 KIR3DL1P43629 444 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 KCNJ1P48048 391 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 ITKQ08881 620 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 DNASE1L3Q13609 305 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 IL10RAQ13651 578 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 GRM3Q14832 879 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 PTPRRQ15256 657 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 CYP1B1Q16678 543 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 UGT8Q16880 541 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 DCAF10Q5QP82 559 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 ERAP2Q6P179 960 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 KDELC1Q6UW63 502 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 FJX1Q86VR8 437 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 PELI3Q8N2H9 469 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 NXPE1Q8N323 547 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 BBS5Q8N3I7 341 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 FAM71DQ8N9W8 422 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 SPATA22Q8NHS9 363 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 PATE1Q8WXA2 126 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 THAP4Q8WY91 577 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 CAPZA3Q96KX2 299 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 SMIM14Q96QK8 99 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 TRIB3Q96RU7 358 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 VAT1Q99536 393 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 AP1M1Q9BXS5 423 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 SLC25A51Q9H1U9 297 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 GLOD4Q9HC38 313 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 SAR1BQ9Y6B6 198 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 A0A0U1RQS6 177 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 SOCS5O75159 536 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 PGLSO95336 258 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 METTL18O95568 372 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 ECEL1O95672 775 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 FUCA1P04066 466 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 FOSL1P15407 271 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 PSMB4P28070 264 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 SERPINA4P29622 427 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 CASQ1P31415 396 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 PTGIRP43119 386 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 SUOXP51687 545 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 KIAA1024LP59773 190 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 BCL2L1Q07817 233 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 RALGDSQ12967 914 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 OLIG2Q13516 323 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 CDSNQ15517 529 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 CFAP58Q5T655 872 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 PID1Q7Z2X4 250 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 CUZD1Q86UP6 607 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 NAGSQ8N159 534 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 HCAR2Q8TDS4 363 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 CT55Q8WUE5 264 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 PIH1D2Q8WWB5 315 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf135-204ENST00000495399 MAIP1Q8WWC4 291 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.6 ms