RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 FBP2O00757 339 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF195O14628 629 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 AXIN1O15169 862 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 LDB2O43679 373 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 HALP42357 657 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 FNTBP49356 437 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 PTSQ03393 145 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 PEX6Q13608 980 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF423Q2M1K9 1284 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 DPPA4Q7L190 304 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 TTC30BQ8N4P2 665 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 EME1Q96AY2 570 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 SIGLEC10Q96LC7 697 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 RANBP9Q96S59 729 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 SORT1Q99523 831 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 MAGEE1Q9HCI5 957 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 SMYD2Q9NRG4 433 aa11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRPM6Q9BX84 2022 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 FUOMA2VDF0 154 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 NEMP1O14524 444 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 AIM2O14862 343 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 UGT1A9O60656 530 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 PLIN3O60664 434 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 MMP20O60882 483 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 OCM2P0CE71 109 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 MLNP12872 115 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 ME2P23368 584 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 VIPR1P32241 457 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 SEPT6Q14141 434 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 INSCQ1MX18 579 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 PIGGQ5H8A4 983 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 ERAP2Q6P179 960 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 EPGNQ6UW88 154 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 CES3Q6UWW8 571 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 UNC5AQ6ZN44 842 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 LILRA2Q8N149 483 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMIGD2Q96BF3 282 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 CDRT15Q96T59 188 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC68Q9H2F9 335 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 CAAP1Q9H8G2 361 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 UGT1A7Q9HAW7 530 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 UGT1A10Q9HAW8 530 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 UGT1A8Q9HAW9 530 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 PLAC1Q9HBJ0 212 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 CHRAC1Q9NRG0 131 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 SELENONQ9NZV5 590 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 GPR179Q6PRD1 2367 aa11.66□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 HMX2A2RU54 273 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRR33A8MZF0 331 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC22A2O15244 555 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 PCDH8O95206 1070 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 C1SP09871 688 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 RALBP11234 206 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 BCKDHBP21953 392 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 FUT4P22083 530 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 BCAP31P51572 246 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 PCLAFQ15004 111 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 TGFBIQ15582 683 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 LIPIQ6XZB0 460 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 CYS1Q717R9 158 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 DSELQ8IZU8 1212 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 OR13C4Q8NGS5 318 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 BRSK1Q8TDC3 778 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 C17orf50Q8WW18 174 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 RAB7BQ96AH8 199 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF597Q96LX8 424 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 BTBD1Q9H0C5 482 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 BPIFA1Q9NP55 256 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPATA7Q9P0W8 599 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 RNF11Q9Y3C5 154 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 TBC1D3EA0A087X179 549 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC162PA2VCL2 907 aa11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TIMMDC1-208ENST00000494664 IGLON5A6NGN9 336 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms