RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493380.5

FRMD4A-208, Transcript of FERM domain containing 4A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FRMD4A, Length 1,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4A-208ENST00000493380 TPM4P67936 248 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 ACY1Q03154 408 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 ATP1A4Q13733 1029 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 DEFB110Q30KQ9 67 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 C4orf17Q53FE4 359 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 DENND5AQ6IQ26 1287 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 NAPRTQ6XQN6 538 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 SYVN1Q86TM6 617 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 OOSP2Q86WS3 158 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 RHOT2Q8IXI1 618 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 CFAP206Q8IYR0 622 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 OR2L2Q8NH16 312 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 BRSK1Q8TDC3 778 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 IQCDQ96DY2 449 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 GBA3Q9H227 469 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 TRABDQ9H4I3 376 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 ASB8Q9H765 288 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 FAM60AQ9NP50 221 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 SMOXQ9NWM0 555 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 POMT2Q9UKY4 750 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 BTRCQ9Y297 605 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 PKP3Q9Y446 797 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa13.07□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 CENPEQ02224 2701 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 NUP210LQ5VU65 1888 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 CCDC78A2IDD5 438 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 GSAPA4D1B5 854 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 TCP11X1B4DZS4 312 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 MEN1O00255 615 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 EPOP01588 193 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 MT-ND3P03897 115 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 TPBGLP0DKB5 382 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 HLA-DPA1P20036 260 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 PRKG2Q13237 762 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 MPP3Q13368 585 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 ZIC1Q15915 447 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 BCL7AQ4VC05 210 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 FAM20CQ8IXL6 584 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 DTX3LQ8TDB6 740 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 P3H4Q92791 437 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 CCDC42Q96M95 316 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 HGH1Q9BTY7 390 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 ACSS2Q9NR19 701 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 TCFL5Q9UL49 500 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 PRSS21Q9Y6M0 314 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 CROCCQ5TZA2 2017 aa13.06□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 CCDC66A2RUB6 948 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 H7C0C1 242 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 PSTPIP1O43586 416 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 CEACAM4O75871 244 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 AGFG2O95081 481 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 SLC35G4P0C7Q5 338 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 CBSLP0DN79 551 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 LPOP22079 712 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 CDH3P22223 829 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 CBSP35520 551 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 ATP5OP48047 213 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 NR2C2P49116 596 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 RPS15P62841 145 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 ITGA9Q13797 1035 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 TFDP2Q14188 446 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 SLC9A5Q14940 896 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 TCEAL1Q15170 157 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 TFDP3Q5H9I0 405 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 IZUMO3Q5VZ72 239 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 SLC6A19Q695T7 634 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 ZNF787Q6DD87 383 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 RANBP10Q6VN20 620 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 ATCAYQ86WG3 371 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 KMT5CQ86Y97 462 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 SYTL1Q8IYJ3 562 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 KATNAL2Q8IYT4 538 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 RNF214Q8ND24 703 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 CCDC110Q8TBZ0 833 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 ACTL9Q8TC94 416 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 INPP5DQ92835 1189 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 TCTN2Q96GX1 697 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 CD180Q99467 661 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 FSD1LQ9BXM9 530 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 GPR87Q9BY21 358 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 OR52A5Q9H2C5 316 aa13.05□□□□□ -0.32
FRMD4A-208ENST00000493380 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms