RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 MFSD3Q96ES6 412 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 FERD3LQ96RJ6 166 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 CTRCQ99895 268 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 KIFC1Q9BW19 673 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 PRORYQ9H606 182 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 APMAPQ9HDC9 416 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 SLC24A2Q9UI40 661 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 ACSL6Q9UKU0 697 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 SDK2Q58EX2 2172 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 AP3B1O00203 1094 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 VAPBO95292 243 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 FTH1P02794 183 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 OR56A5P0C7T3 313 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 TCP1P17987 556 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 SARNPP82979 210 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 MC2RQ01718 297 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 RPA4Q13156 261 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 PPP1R7Q15435 360 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 CASC4Q6P4E1 433 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 CERS6Q6ZMG9 384 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 VASH2Q86V25 355 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 OTUD6BQ8N6M0 293 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 GRK7Q8WTQ7 553 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 SGSM3Q96HU1 749 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 TTC1Q99614 292 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 DDA1Q9BW61 102 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 HRASLS2Q9NWW9 162 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 EPHA6Q9UF33 1036 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 SOX13Q9UN79 622 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 ATRXP46100 2492 aa11.71□□□□□ -0.53
NISCH-214ENST00000490425 CFAP46Q8IYW2 2715 aa11.71□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 OR6C74A6NCV1 312 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 OR5K3A6NET4 321 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 IQCF5A8MTL0 148 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 QSOX1O00391 747 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 FANCGO15287 622 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 GSTM1P09488 218 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 ANKRD34CP0C6C1 535 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 LIPCP11150 499 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 ARNTP27540 789 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 PTGIRP43119 386 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 CD151P48509 253 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 TTPAP49638 278 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 TMPRSS3P57727 454 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 RAB15P59190 212 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 SH3BP2P78314 561 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 GSTM4Q03013 218 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 FOXM1Q08050 763 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 PRKG2Q13237 762 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 SYTL3Q4VX76 610 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 DCAF12Q5T6F0 453 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 ARHGAP40Q5TG30 622 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 ZNF449Q6P9G9 518 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 KLHL35Q6PF15 583 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 PRSS42Q7Z5A4 293 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 CREG2Q8IUH2 290 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 KRT222Q8N1A0 295 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 MCUQ8NE86 351 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 OR4E2Q8NGC2 313 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 ZDHHC12Q96GR4 267 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 SERPINB12Q96P63 405 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 HGH1Q9BTY7 390 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 SLC5A10A0PJK1 596 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 CTAGE9A4FU28 777 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 SDR42E2A6NKP2 422 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 EFSO43281 561 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 NDUFS3O75489 264 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 F7P08709 466 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 CD82P27701 267 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 NDUFS1P28331 727 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 CCR7P32248 378 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-214ENST00000490425 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms