RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF786Q8N393 782 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD200R1Q8TD46 325 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP1R14BQ96C90 147 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HGH1Q9BTY7 390 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRMOQ9BU70 441 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SAGE1Q9NXZ1 904 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL17CQ9P0M4 197 aa15.27■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LAMA1P25391 3075 aa15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GIPC1O14908 333 aa15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C8BP07358 591 aa15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LBX1P52954 281 aa15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAD51Q06609 339 aa15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC14A2Q15849 920 aa15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP51A1Q16850 503 aa15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKS6Q68DC2 871 aa15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OFCC1Q8IZS5 231 aa15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STAG3L4Q8TBR4 150 aa15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FATE1Q969F0 183 aa15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL26Q9NPH9 171 aa15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZMYM5Q9UJ78 669 aa15.27■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHRS12A0PJE2 317 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLL1O43897 1013 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR4F21O95013 312 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PGLSO95336 258 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITIH5Q86UX2 942 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SFTPA1Q8IWL2 248 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AHI1Q8N157 1196 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM199Q8N511 208 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF225Q9UK10 706 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMED5Q9Y3A6 229 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNX2O60749 519 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPAN12O95859 305 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLUD1P00367 558 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SRCP12931 536 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TYSND1Q2T9J0 566 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCEAL5Q5H9L2 206 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAGE3Q5JUK9 113 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LY6G5CQ5SRR4 150 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYVN1Q86TM6 617 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FOXJ1Q92949 421 aa15.26■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRM6O15303 877 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BPIP17213 487 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GGT5P36269 586 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 METAP1P53582 386 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNK2Q07912 1038 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LCP2Q13094 533 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SGO1Q5FBB7 561 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FNDC5Q8NAU1 212 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR26Q8NDV2 337 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCAMP4Q969E2 229 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC58Q96CX6 371 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DENND4CQ5VZ89 1909 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KANSL1LA0AUZ9 987 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLK4O00444 970 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FFAR3O14843 346 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR42O15529 346 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC6A2P23975 617 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPA13P48723 471 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNK10P57789 538 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC66Q68CR7 880 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OAZ3Q9UMX2 235 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DOCK9Q9BZ29 2069 aa15.25■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS26AO75436 327 aa15.24■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGBP02675 491 aa15.24■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCNAP12004 261 aa15.24■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IDO1P14902 403 aa15.24■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VIPR2P41587 438 aa15.24■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP1A4Q13733 1029 aa15.24■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM215Q68D42 235 aa15.24■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RETSATQ6NUM9 610 aa15.24■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCAF4L2Q8NA75 395 aa15.24■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC3BQ96PB8 259 aa15.24■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDUFA13Q9P0J0 144 aa15.24■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GBF1Q92538 1859 aa15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms