RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 VAV2P52735 878 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 FOXL2P58012 376 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 ATP1A4Q13733 1029 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 GTF2H3Q13889 308 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 PLCL1Q15111 1095 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 PTCHD3Q3KNS1 767 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 FILIP1LQ4L180 1135 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 TEX44Q53QW1 395 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 FIGNQ5HY92 759 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 GPRC6AQ5T6X5 926 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 SLC9A4Q6AI14 798 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 CYB5D1Q6P9G0 228 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 KDELC1Q6UW63 502 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 FAM198BQ6UWH4 519 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 MICALCLQ6ZW33 695 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 DET1Q7L5Y6 550 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 SLC25A41Q8N5S1 370 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 SEC14L1Q92503 715 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 PNPLA2Q96AD5 504 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 TTC25Q96NG3 672 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 LRFN5Q96NI6 719 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 TLR10Q9BXR5 811 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 NLNQ9BYT8 704 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 KLHL25Q9H0H3 589 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 IL17CQ9P0M4 197 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 SLC24A2Q9UI40 661 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 SNX7Q9UNH6 387 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 PCSK5Q92824 1860 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 LRRK2Q5S007 2527 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 SGTAO43765 313 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 POLBP06746 335 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 CTSBP07858 339 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 PTPN3P26045 913 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 GPC1P35052 558 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 PBX1P40424 430 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 WNT3AP56704 352 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 GSDMDP57764 484 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 XRCC4Q13426 336 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 MESDQ14696 234 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 IQCB1Q15051 598 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 LLGL1Q15334 1064 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 SIRPB2Q5JXA9 342 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 TMTC4Q5T4D3 741 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 C1QL3Q5VWW1 255 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 KLHL35Q6PF15 583 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 FAM151BQ6UXP7 276 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 OOSP2Q86WS3 158 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 CPT1BQ92523 772 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 INPP5DQ92835 1189 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 TEKT5Q96M29 485 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 C12orf66Q96MD2 445 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 OLFM3Q96PB7 478 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 CD180Q99467 661 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 BPIFA3Q9BQP9 254 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 BTRCQ9Y297 605 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.2□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1W2PQJ5 194 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 LRRD1A4D1F6 860 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 MGAT4DA6NG13 374 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 SMTNL1A8MU46 457 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 BTN3A3O00478 584 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 APOL1O14791 398 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 HCRTR1O43613 425 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 CBSLP0DN79 551 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 PVRP15151 417 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 ST6GAL1P15907 406 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 NFKB1P19838 968 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 CDH3P22223 829 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 OTX2P32243 289 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 CBSP35520 551 aa8.19□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 SPAM1P38567 509 aa8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms