RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 WASH2PQ6VEQ5 465 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PDZD3Q86UT5 571 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 FAM45AQ8TCE6 357 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CD200R1Q8TD46 325 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CXorf40BQ96DE9 158 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 C12orf66Q96MD2 445 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PAFAH2Q99487 392 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 OLFM1Q99784 485 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 FUT8Q9BYC5 575 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 EPB41L4BQ9H329 900 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 TAS2R13Q9NYV9 303 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 LRIT1Q9P2V4 623 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CPNE7Q9UBL6 633 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SLC39A10Q9ULF5 831 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CDYLQ9Y232 598 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 VWA7Q9Y334 891 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 IKBKGQ9Y6K9 419 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 RNF215Q9Y6U7 377 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SPEGQ15772 3267 aa8.64□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 FAM186AA6NE01 2351 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 OR5K4A6NMS3 321 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 RHPN2P1A8MT19 583 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 GIPC1O14908 333 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PPM1DO15297 605 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 TNFSF14O43557 240 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 GPC4O75487 556 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SLCO2B1O94956 709 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 VIPP01282 170 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SHBGP04278 402 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 INHBAP08476 426 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ITGA2BP08514 1039 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 GLB1P16278 677 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SDHBP21912 280 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 FDXRP22570 491 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 HSD17B3P37058 310 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SLC19A1P41440 591 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 MSH2P43246 934 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 LIMK2P53671 638 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SLC12A2P55011 1212 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 TAS2R39P59534 338 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 HHEXQ03014 270 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ABRQ12979 859 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 BMPR2Q13873 1038 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 KRT33BQ14525 404 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF460Q14592 562 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 TTLL9Q3SXZ7 439 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 MAP9Q49MG5 647 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PERM1Q5SV97 790 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 MROH9Q5TGP6 573 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 UGT3A1Q6NUS8 523 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PAQR3Q6TCH7 311 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CPNE9Q8IYJ1 553 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SLC22A15Q8IZD6 547 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PHC3Q8NDX5 983 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CFAP61Q8NHU2 1237 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 IFI44Q8TCB0 444 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 SLC44A1Q8WWI5 657 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 INPP5DQ92835 1189 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CAVIN3Q969G5 261 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 RTKNQ9BST9 563 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 POT1Q9NUX5 634 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 DHRS7Q9Y394 339 aa8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa8.62□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CASQ1-202ENST00000467691 CASC3O15234 703 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms