RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 CCKBRP32239 447 aa17.97■□□□□ 0.47
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DDR1-241ENST00000460944 E5RI56 91 aa17.96■□□□□ 0.47
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DDR1-241ENST00000460944 C1QTNF9P0C862 333 aa17.95■□□□□ 0.46
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DDR1-241ENST00000460944 STEAP4Q687X5 459 aa17.95■□□□□ 0.46
DDR1-241ENST00000460944 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
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DDR1-241ENST00000460944 TMEM8BA6NDV4 472 aa17.94■□□□□ 0.46
DDR1-241ENST00000460944 NIPSNAP2O75323 286 aa17.94■□□□□ 0.46
DDR1-241ENST00000460944 MPOP05164 745 aa17.94■□□□□ 0.46
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DDR1-241ENST00000460944 CAPZBP47756 277 aa17.94■□□□□ 0.46
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DDR1-241ENST00000460944 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
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DDR1-241ENST00000460944 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
DDR1-241ENST00000460944 ZNF789Q5FWF6 425 aa17.94■□□□□ 0.46
DDR1-241ENST00000460944 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa17.94■□□□□ 0.46
DDR1-241ENST00000460944 FOXR1Q6PIV2 292 aa17.94■□□□□ 0.46
DDR1-241ENST00000460944 KIAA0408Q6ZU52 694 aa17.94■□□□□ 0.46
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