RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 IZUMO3Q5VZ72 239 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 FCRL6Q6DN72 434 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ENPP7Q6UWV6 458 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 IGFL3Q6UXB1 125 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 VPS36Q86VN1 386 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SFTPA2Q8IWL1 248 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PLA2G15Q8NCC3 412 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CT55Q8WUE5 264 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 NRGNQ92686 78 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TAF4BQ92750 862 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 INPP5DQ92835 1189 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGEF26Q96DR7 871 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 HERPUD2Q9BSE4 406 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SMYD3Q9H7B4 428 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PDE7BQ9NP56 450 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM9Q9P0T7 183 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PDP2Q9P2J9 529 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 FADS3Q9Y5Q0 445 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.99□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SH3D21A4FU49 640 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF233A6NK53 670 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 FOXO6A8MYZ6 492 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 F2RL2O00254 374 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 DAPK3O43293 454 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 MSI1O43347 362 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNAB3O43448 404 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 IPO13O94829 963 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA0754O94854 1291 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 NDUFA10O95299 355 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PDGFRAP16234 1089 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TNNI1P19237 187 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 DDCP20711 480 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TNFSF4P23510 183 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 DNASE1P24855 282 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CA7P43166 264 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 DGKQP52824 942 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 NDST2P52849 883 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PLK1P53350 603 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CASP6P55212 293 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS18P62269 152 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 DLG4P78352 724 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 FMO1Q01740 532 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 RAPSNQ13702 412 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM29Q14134 588 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 NFATC4Q14934 902 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CNGA2Q16280 664 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF667Q5HYK9 610 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 MS4A13Q5J8X5 152 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 FAAH2Q6GMR7 532 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 Q6ZS92 163 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 MED25Q71SY5 747 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CUZD1Q86UP6 607 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 UNC93AQ86WB7 457 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 GPBP1Q86WP2 473 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R3BQ86XI6 285 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PLXDC1Q8IUK5 500 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SYCP3Q8IZU3 236 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CRYBG2Q8N1P7 616 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CFAP52Q8N1V2 620 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 GPD1LQ8N335 351 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SH2D3CQ8N5H7 860 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 C12orf29Q8N999 325 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ACBD4Q8NC06 268 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 WFDC11Q8NEX6 87 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 OR2A12Q8NGT7 310 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 OR10G6Q8NH81 332 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 RAB24Q969Q5 203 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 AZIN2Q96A70 460 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 RAB7BQ96AH8 199 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PDXPQ96GD0 296 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TMX3Q96JJ7 454 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 FIZ1Q96SL8 496 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SLX1AQ9BQ83 275 aa3.98□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF559Q9BR84 538 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms