RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC68Q9H2F9 335 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PRDM8Q9NQV8 689 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SIRPGQ9P1W8 387 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFATQ9P243 1243 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CRYL1Q9Y2S2 319 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 COMMD10Q9Y6G5 202 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa10.39□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 KPNA5O15131 536 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 NOBOXO60393 691 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 F3P13726 295 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PKMP14618 531 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 STX2P32856 288 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 MPP1Q00013 466 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 RPA4Q13156 261 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 TUBB8Q3ZCM7 444 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 C14orf28Q4W4Y0 310 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC26A11Q86WA9 606 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC35F3Q8IY50 421 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 AVL9Q8NBF6 648 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 BIRC8Q96P09 236 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PADI4Q9UM07 663 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A0G2JNG1 304 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 A6NCN8 305 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PDZK1P1A8MUH7 402 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 KIR2DS3K7RE56 304 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 EBAG9O00559 213 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 HAUS5O94927 633 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PHBP35232 272 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 HALP42357 657 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 KIR2DS5Q14953 304 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 KYNUQ16719 465 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF789Q5FWF6 425 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 NAGSQ8N159 534 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 KYQ8NBH2 561 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 MDM1Q8TC05 714 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 MAPK15Q8TD08 544 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ELMO1Q92556 727 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 COG4Q9H9E3 785 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 NINJ2Q9NZG7 142 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 AHSGP02765 367 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CDK4P11802 303 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ACP1P24666 158 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CAMK2BQ13554 666 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CTSL3PQ5NE16 218 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CNSTQ6PJW8 725 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC9B2Q86UD5 537 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SFRP1Q8N474 314 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ARL14Q8N4G2 192 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM76AQ8TAV0 307 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 NAT6Q93015 286 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM210AQ96ND0 272 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM8A1Q9UBU6 413 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 U3KQA8 63 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 PKD1L2Q7Z442 2459 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 BPTFQ12830 3046 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM159BA6NKW6 160 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 IQCF5A8MTL0 148 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 EML2O95834 649 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 APOA4P06727 396 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC35G4P0C7Q5 338 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 GLB1P16278 677 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ITGB6P18564 788 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CHRM3P20309 590 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 RPL10P27635 214 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 AOAHP28039 575 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CCR7P32248 378 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CD151P48509 253 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ILKQ13418 452 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 BIRC2Q13490 618 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 TMED2Q15363 201 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SYTL3Q4VX76 610 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 FBF1Q8TES7 1133 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ASZ1Q8WWH4 475 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM159Q96B96 161 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 LATS2Q9NRM7 1088 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHL42Q9P2K6 505 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC5A10A0PJK1 596 aa10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms