RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449489.5

RBM39-218, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 5

Gene RBM39, Length 432 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-218ENST00000449489 OLAHQ9NV23 265 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 CD84Q9UIB8 345 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 BTRCQ9Y297 605 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 NUP210LQ5VU65 1888 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 A0A0J9YYE9 177 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 C9J4A7 227 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 KMOO15229 486 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 KCNJ13O60928 360 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 MTA2O94776 668 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 TRBC1P01850 177 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 HBQ1P09105 142 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 KRT3P12035 628 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 TNFAIP3P21580 790 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 EPHA1P21709 976 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 PBX1P40424 430 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 CA7P43166 264 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 ART1P52961 327 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 KRT85P78386 507 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 TLE4Q04727 773 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 SLC10A7Q0GE19 358 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 TRAF2Q12933 501 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 CDC16Q13042 620 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 INAQ16352 499 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 ZNF677Q86XU0 584 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 PHC3Q8NDX5 983 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 JOSD2Q8TAC2 188 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 ZFPM2Q8WW38 1151 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 NR4A3Q92570 626 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 SMARCE1Q969G3 411 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 SNX21Q969T3 373 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 WDR24Q96S15 920 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 MAP3K3Q99759 626 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 SIX2Q9NPC8 291 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 P4HTMQ9NXG6 502 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 CCL21O00585 134 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 FANCGO15287 622 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 PEX11BO96011 259 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 CELA3AP09093 270 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 GPD1P21695 349 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 IDSP22304 550 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 ARNTP27540 789 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 OTX2P32243 289 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 KIR3DL1P43629 444 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 SPINT3P49223 89 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 SMSP52788 366 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 TPI1P60174 286 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 RPL26P61254 145 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 PPP1CAP62136 330 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 GPR19Q15760 415 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 ZNF789Q5FWF6 425 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 FAM69BQ5VUD6 431 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 WDR59Q6PJI9 974 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 CERS6Q6ZMG9 384 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 SULF2Q8IWU5 870 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 BBS5Q8N3I7 341 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 TEKT4Q8WW24 435 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 NELFBQ8WX92 580 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 CXorf40BQ96DE9 158 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 AGAP4Q96P64 663 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 LMF1Q96S06 567 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-218ENST00000449489 FOXC2Q99958 501 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms