RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 B4GALT4O60513 344 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TSPAN8P19075 237 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CCNCP24863 283 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 NDST2P52849 883 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TUSC3Q13454 348 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 NAE1Q13564 534 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 RHEBQ15382 184 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 COQ8BQ96D53 544 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 APOLD1Q96LR9 279 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 C7orf26Q96N11 449 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ZNF570Q96NI8 536 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 EPYCQ99645 322 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TLE6Q9H808 572 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 C9J4A7 227 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 NPHS1O60500 1241 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ENTPD6O75354 484 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SHBGP04278 402 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 MAGEA12P43365 314 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 KCNJ2P63252 427 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SP3Q02447 781 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 AHSA2Q719I0 299 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CDH22Q9UJ99 828 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 WASF3Q9UPY6 502 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 A0A0J9YVX5 310 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 A0A1B0GVM2 712 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 OR2AG2A6NM03 316 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PDPK1O15530 556 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 HSD11B1P28845 292 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SLC7A1P30825 629 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PBX3P40426 434 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SELENOVP59797 346 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SP140Q13342 867 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DLG2Q15700 870 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ABHD13Q7L211 337 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PRELID2Q8N945 189 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NAT14Q8WUY8 206 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 AGAP2Q99490 1192 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GIN1Q9NXP7 522 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.59□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 WNT10BO00744 389 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 FSCN2O14926 492 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GADD45GO95257 159 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZNF806P0C7X5 589 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SRCP12931 536 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PTPRAP18433 802 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PTGER3P43115 390 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NOMO3P69849 1222 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 LINGO2Q7L985 606 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TDRPQ86YL5 185 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 OR8H3Q8N146 312 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NR4A3Q92570 626 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NKD1Q969G9 470 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GRHL1Q9NZI5 618 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ANXA8P13928 327 aa6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 IST1P53990 364 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms