RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC22A1O15245 554 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 KERAO60938 352 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 CD36P16671 472 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 FMO3P31513 532 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 TIE1P35590 1138 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 INHBEP58166 350 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 ADAM17P78536 824 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 ABATP80404 500 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 MXD1Q05195 221 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 MADCAM1Q13477 382 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM110CQ1W6H9 321 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 IFI44LQ53G44 452 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 KRT77Q7Z794 578 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 DENND1AQ8TEH3 1009 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 PIK3R3Q92569 461 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 TMBIM1Q969X1 311 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM83DQ9H4H8 585 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 EXD2Q9NVH0 621 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 CFAP97Q9P2B7 532 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 NDOR1Q9UHB4 597 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF510Q9Y2H8 683 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 MYH8P13535 1937 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 E7ESA3 106 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 PPEF2O14830 753 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM189A1O60320 539 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 CCNB2O95067 398 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 SNX4O95219 450 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 C8BP07358 591 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 CCL23P55773 120 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC10A7Q0GE19 358 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 NPTX1Q15818 432 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 ZBTB6Q15916 424 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF730Q6ZMV8 503 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC51AQ86UW1 340 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 CDK15Q96Q40 435 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 GALPQ9UBC7 116 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 STYXL1Q9Y6J8 313 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 PTPRJQ12913 1337 aa11.02□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 ARHGEF33A8MVX0 844 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 K7EPI3 171 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 NIPSNAP2O75323 286 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 ERN1O75460 977 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 LINGO3P0C6S8 592 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 DNAJB1P25685 340 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 CCR10P46092 362 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 SULT2A1Q06520 285 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 FCHO2Q0JRZ9 810 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 MPPE1Q53F39 396 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 MED27Q6P2C8 311 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 RAD51AP1Q96B01 352 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 CCDC106Q9BWC9 280 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 LMAN2LQ9H0V9 348 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 MBD2Q9UBB5 411 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 TRPS1Q9UHF7 1281 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 UBR1Q8IWV7 1749 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM86C2PA6NEL3 165 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 FFAR2O15552 330 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 ECI2O75521 394 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 PRKD3O94806 890 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 CYP11A1P05108 521 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 RHAGQ02094 409 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 TIGD5Q53EQ6 642 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 HFE2Q6ZVN8 426 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 ADAMTS15Q8TE58 950 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 HSPBAP1Q96EW2 488 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 C8orf48Q96LL4 319 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 RRAGCQ9HB90 399 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 MAT2BQ9NZL9 334 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 ZIM2Q9NZV7 527 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 OR10H1Q9Y4A9 318 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 URADA6NGE7 173 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 OR2AG2A6NM03 316 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 J3QRK9 145 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 PER2O15055 1255 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 GRM6O15303 877 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 CHST10O43529 356 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 OR10H2O60403 315 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 JAG1P78504 1218 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 HMGCS1Q01581 520 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 FOXM1Q08050 763 aa11.01□□□□□ -0.65
SEMA4D-211ENST00000438547 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 345.4 ms