RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NFS1Q9Y697 457 aa9.2□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ITPR1Q14643 2758 aa9.2□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LILRA5A6NI73 299 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NDUFS3O75489 264 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AP2A2O94973 939 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 S1PR4O95977 384 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C1QAP02745 245 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MPOP05164 745 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC35G4P0C7Q5 338 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TPBGLP0DKB5 382 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ITIH1P19827 911 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SSTR1P30872 391 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TTPAP49638 278 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLTPP55058 493 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BIRC2Q13490 618 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ISXQ2M1V0 245 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SYTL3Q4VX76 610 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WASH2PQ6VEQ5 465 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM26Q6ZUK4 368 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC9B2Q86UD5 537 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MMGT1Q8N4V1 131 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PHC3Q8NDX5 983 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KIF18AQ8NI77 898 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CERS2Q96G23 380 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C9orf72Q96LT7 481 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC38A3Q99624 504 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 XKR8Q9H6D3 395 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC40A1Q9NP59 571 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WASH6PQ9NQA3 447 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 POT1Q9NUX5 634 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GNPTGQ9UJJ9 305 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FBXO5Q9UKT4 447 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SATB2Q9UPW6 733 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MSRB2Q9Y3D2 182 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM169AQ9Y6X4 670 aa9.19□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LOC400499M0QZD8 3231 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AP3B1O00203 1094 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SEC16AO15027 2179 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HAUS5O94927 633 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VIPP01282 170 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FTH1P02794 183 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR56A5P0C7T3 313 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CTAGE8P0CG41 777 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 THRAP10827 490 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 JUPP14923 745 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VCLP18206 1134 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PAMP19021 973 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AOAHP28039 575 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ACADLP28330 430 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GMPRP36959 345 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CAPZBP47756 277 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CARSP49589 748 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDKN2DP55273 166 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPX6P59796 221 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRKG2Q13237 762 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PHF19Q5T6S3 580 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CERS6Q6ZMG9 384 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAATS1Q7Z4T9 603 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CTAGE6Q86UF2 777 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CTAGE4Q8IX94 777 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PDIK1LQ8N165 341 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SEC14L1Q92503 715 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IL17FQ96PD4 163 aa9.18□□□□□ -0.94
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DEPDC7Q96QD5 511 aa9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms