RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.71□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.71□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF623O75123 536 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 CYBAP13498 195 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ACVR2AP27037 513 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 GPR15P49685 360 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 LAPTM5Q13571 262 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 KCNA10Q16322 511 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 SCD5Q86SK9 330 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 EID3Q8N140 333 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 YIPF6Q96EC8 236 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 HMCESQ96FZ2 354 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ARL5AQ9Y689 179 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 CDC7O00311 574 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ENPP3O14638 875 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 SLC16A6O15403 523 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 FLT3LGP49771 235 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 TPTEP56180 551 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 CDK5R2Q13319 367 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 DDR2Q16832 855 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZSR9 355 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 P2RY8Q86VZ1 359 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 OR4L1Q8NH43 312 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 GPR152Q8TDT2 470 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 PKMYT1Q99640 499 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 SP110Q9HB58 689 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ADGRE2Q9UHX3 823 aa14.7□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 M0QX08 132 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 MAN1A2O60476 641 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 B4GALT3O60512 393 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 OR4F21O95013 312 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 CYP11A1P05108 521 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 OR13C4Q8NGS5 318 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 BTBD2Q9BX70 525 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ACTL8Q9H568 366 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 EXD2Q9NVH0 621 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 GALPQ9UBC7 116 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 FAM50BQ9Y247 325 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 M0QZQ0 153 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 XPNPEP2O43895 674 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ALDH4A1P30038 563 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 SERPINB1P30740 379 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 DCTP40126 519 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 DGKQP52824 942 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 VBP1P61758 197 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 CDC20Q12834 499 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 RFX4Q33E94 735 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 TEX26Q8N6G2 289 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 CNIH3Q8TBE1 160 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 UTS2RQ9UKP6 389 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 MED16Q9Y2X0 877 aa14.69□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 TTC34A8MYJ7 566 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 BCKDKO14874 412 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ANGPTL1O95841 491 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 G6PDP11413 515 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 FRS2Q8WU20 508 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 SUSD3Q96L08 255 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 SP140LQ9H930 580 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.68□□□□□ -0.06
TOP3B-206ENST00000436282 KLQ9UEF7 1012 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms