RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421051.1

AP000289.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP000289.1, Length 1,361 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000289.1-201ENST00000421051 SGK2Q9HBY8 427 aa9.49□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.49□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 KLHL3Q9UH77 587 aa9.49□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ERVK-11Q9UQG0 969 aa9.49□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 CDRT15L2A8MXV6 281 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 CFAP99D6REC4 459 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 H0YCG3 227 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 TLR4O00206 839 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 RGS13O14921 159 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 TNFSF15O95150 251 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 PIGRP01833 764 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 DNTTP04053 509 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 THEGLP0DJG4 465 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 JAK1P23458 1154 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 IL1R2P27930 398 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 PNPLA4P41247 253 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 BMPR2Q13873 1038 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 CLCA4Q14CN2 919 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ISXQ2M1V0 245 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 C2CD6Q53TS8 623 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 SCARA3Q6AZY7 606 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF787Q6DD87 383 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 IGF2-ASQ6U949 168 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 HACD2Q6Y1H2 254 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 HTR3DQ70Z44 454 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF534Q76KX8 674 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 GALNT4Q8N4A0 578 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ARL14Q8N4G2 192 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 TTC30BQ8N4P2 665 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF606Q8WXB4 792 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 FBXO32Q969P5 355 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 FAF2Q96CS3 445 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 DHRS1Q96LJ7 313 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF347Q96SE7 839 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 EFHD1Q9BUP0 239 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 IMPG2Q9BZV3 1241 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 CIPCQ9C0C6 399 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 TPK1Q9H3S4 243 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 COG4Q9H9E3 785 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 EFCAB1Q9HAE3 211 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 PARVBQ9HBI1 364 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 TCF7L2Q9NQB0 619 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ELOVL2Q9NXB9 296 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 MID2Q9UJV3 735 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 FBXO10Q9UK96 956 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa9.48□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 A0A1W2PR77 199 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 PMS2P1A4D2B8 440 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 DLGAP1O14490 977 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 GABRDO14764 452 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 HDAC3O15379 428 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 TFPTP0C1Z6 253 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 TGM2P21980 687 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 COL8A1P27658 744 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 CASRP41180 1078 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 GSSP48637 474 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 NXPH1P58417 271 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 CYP4F2P78329 520 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 NR1D2Q14995 579 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 TGIF1Q15583 401 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 DCUN1D2Q6PH85 259 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF366Q8N895 744 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 OR13F1Q8NGS4 319 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 RDH11Q8TC12 318 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 C8orf48Q96LL4 319 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 NSMCE3Q96MG7 304 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 DRC3Q9H069 523 aa9.47□□□□□ -0.89
AP000289.1-201ENST00000421051 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms