RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNPLA2Q96AD5 504 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASS4Q9NQ75 786 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1GALT1Q9NS00 363 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCMTD2Q9NV79 361 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR83Q9NYM4 423 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFNKQ9P0W0 207 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCSK5Q92824 1860 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM150CB9EJG8 249 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MATN2O00339 956 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF185O15231 689 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKR1B10O60218 316 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CST8O60676 142 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCA5LO95447 670 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDAH2O95865 285 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAPN1P07384 714 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PYGMP11217 842 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTMSP20962 102 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VARSP26640 1264 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDKN2BP42772 138 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC1A1P43005 524 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RRADP55042 308 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGA1P56199 1179 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPRCAPQ14761 206 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF789Q5FWF6 425 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED25Q71SY5 747 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB2Q8N680 514 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLIS1Q8NBF1 620 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4E2Q8NGC2 313 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1L3Q8NH93 324 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VAT1Q99536 393 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FSD1LQ9BXM9 530 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYTL2Q9HCH5 934 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP10Q9P2G4 905 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPTBP11277 2137 aa12.8□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYCE3A1L190 88 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSAPA4D1B5 854 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A6NL46 340 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGTAO43765 313 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSL3P1P0C860 447 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP2A7P20853 494 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PREPP48147 710 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP1A4Q13733 1029 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT33BQ14525 404 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCF4Q15080 339 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAZQ16635 292 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KAZNQ674X7 775 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PID1Q7Z2X4 250 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAAM2Q86T65 1068 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACVR1CQ8NER5 493 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HM13Q8TCT9 377 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC7Q99615 494 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASB8Q9H765 288 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSPH14Q9UHP6 348 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HYOU1Q9Y4L1 999 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARL5AQ9Y689 179 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa12.79□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPOPO43791 374 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRP72O76094 671 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLBP06746 335 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST6GAL1P15907 406 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COMTP21964 271 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LMAN1P49257 510 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRLHRP49683 370 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADCY2Q08462 1091 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LLGL1Q15334 1064 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTCHD3Q3KNS1 767 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB43Q86YS6 212 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP206Q8IYR0 622 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4K2Q8NGD2 314 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8K1Q8NGG5 319 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR7Q8TB68 274 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCN9Q8WX39 176 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P3H4Q92791 437 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAUS1Q96CS2 278 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGSM3Q96HU1 749 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCM2Q9BSQ5 444 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PITPNM3Q9BZ71 974 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRMSQ9H3Y6 488 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPTLC3Q9NUV7 552 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FKBPLQ9UIM3 349 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PADI2Q9Y2J8 665 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf81A6NN90 581 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C9J4A7 227 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E7EQ34 232 aa12.78□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTN3A1O00481 513 aa12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms