RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420234.5

PUM2-205, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-205	ENST00000420234	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CNTD1	Q8N815	330 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PRELID2	Q8N945	189 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	RLN3	Q8WXF3	142 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ARRDC3	Q96B67	414 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TADA1	Q96BN2	335 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	BIRC7	Q96CA5	298 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	VPS35	Q96QK1	796 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PANX3	Q96QZ0	392 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CDC6	Q99741	560 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ERP44	Q9BS26	406 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	VPS18	Q9P253	973 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234		R4GN57	208 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	C5orf42	Q9H799	3197 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	THADA	Q6YHU6	1953 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	OR5K4	A6NMS3	321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234		H7C0S8	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	KMO	O15229	486 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SLC31A1	O15431	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	FLRT2	O43155	660 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	AP2A2	O94973	939 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	METTL18	O95568	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	AGT	P01019	485 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SLC4A1	P02730	911 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	FTH1	P02794	183 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CAPNS1	P04632	268 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PCCB	P05166	539 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	OR56A5	P0C7T3	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF806	P0C7X5	589 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TDGF1	P13385	188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PRKCA	P17252	672 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CTPS1	P17812	591 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PGAM1	P18669	254 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	AKT1	P31749	480 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	STX2	P32856	288 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	HAL	P42357	657 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NSG1	P42857	185 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MAGEA6	P43360	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	RGR	P47804	291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	KCNJ1	P48048	391 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	VPS41	P49754	854 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	STC1	P52823	247 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67	4e-7	■■■□□ 18.9
PUM2-205	ENST00000420234	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NAB1	Q13506	487 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ITIH4	Q14624	930 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NFATC4	Q14934	902 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TMED2	Q15363	201 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TTC23L	Q6PF05	361 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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