RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LRIT3Q3SXY7 679 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM171A1Q5VUB5 890 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DHRSXQ8N5I4 330 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GIPC3Q8TF64 312 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BCL7BQ9BQE9 202 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HAUS8Q9BT25 410 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TAPBPLQ9BX59 468 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC6A14Q9UN76 642 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL5AQ9Y689 179 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0B4J293 547 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GSTT2P0CG29 244 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GSTT2BP0CG30 244 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PSEN2P49810 448 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FCGRTP55899 365 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEP78395 509 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CCNA1P78396 465 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR107Q5VW38 600 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TLK2Q86UE8 772 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZSWIM9Q86XI8 627 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF31Q96EP0 1072 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ASB2Q96Q27 587 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SEMA3CQ99985 751 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM83CQ9BQN1 747 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MID1IP1Q9NPA3 183 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS18Q9NS28 235 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BTRCQ9Y297 605 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GIT1Q9Y2X7 761 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 COL4A3Q01955 1670 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0D9SEW6 157 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CYBAP13498 195 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC15A1P46059 708 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CCR3P51677 355 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PIGFQ07326 219 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MON1AQ86VX9 555 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CROCCP3Q8IVE0 287 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC103Q8IW40 242 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJB14Q8TBM8 379 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CYGBQ8WWM9 190 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 EGLN2Q96KS0 407 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ARVCFO00192 962 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NIPSNAP2O75323 286 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SRP72O76094 671 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4F21O95013 312 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4Q2P0C623 313 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PIRTP0C851 137 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RAP2AP10114 183 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FASP25445 335 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MVKQ03426 396 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ABRAXAS2Q15018 415 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPK11Q15759 364 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM26DQ5JW98 314 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2UQ5VVX9 321 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4F3Q6IEY1 312 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ATPAF2Q8N5M1 289 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CALML6Q8TD86 181 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LMLNQ96KR4 655 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR21Q99679 349 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 VN1R3Q9BXE9 311 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SMURF2Q9HAU4 748 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FANCEQ9HB96 536 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OSGIN1Q9UJX0 560 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CDH23Q9H251 3354 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SERTM1A2A2V5 107 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A3O75751 556 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RPP40O75818 363 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GLUD1P00367 558 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00032P0C843 101 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK5R2Q13319 367 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MEP1AQ16819 746 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RAP1GAP2Q684P5 730 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PRMT9Q6P2P2 845 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB46Q86UZ6 589 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LACC1Q8IV20 430 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MIER2Q8N344 545 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF485Q8NCK3 441 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf50Q9BV19 199 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TULP3O75386 442 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PCSK1P29120 753 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR15P49685 360 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GAS1P54826 345 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MTPNP58546 118 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CLLU1OSQ5K130 101 aa3.56□□□□□ -1.84
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