RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 PADI1Q9ULC6 663 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 SPTBP11277 2137 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 CCNYL3P0C7X3 344 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 PDHA2P29803 388 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 PREPP48147 710 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 HSD11B2P80365 405 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 POU6F1Q14863 301 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 PEX26Q7Z412 305 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 GAS2L3Q86XJ1 694 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 PIANPQ8IYJ0 282 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 D2HGDHQ8N465 521 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 CLDN19Q8N6F1 224 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 SLC38A9Q8NBW4 561 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 HM13Q8TCT9 377 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 ULK4Q96C45 1275 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 TMEM121Q9BTD3 319 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 TLR10Q9BXR5 811 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 TWSG1Q9GZX9 223 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 ACTL8Q9H568 366 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-208ENST00000392449 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 PIPSLA2A3N6 862 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 CREG1O75629 220 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 DNAJB5O75953 348 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 PTMAP06454 111 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 RALBP11234 206 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 KRT33BQ14525 404 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 IGFBP7Q16270 282 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 ARMC6Q6NXE6 501 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 SERPINA9Q86WD7 417 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 PHC3Q8NDX5 983 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 CD180Q99467 661 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 KLHL25Q9H0H3 589 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 OR52A5Q9H2C5 316 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 COG4Q9H9E3 785 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 SOHLH2Q9NX45 425 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 AMFRQ9UKV5 643 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 FLNCQ14315 2725 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 NBASA2RRP1 2371 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 OR51F1A6NGY5 319 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 ACRV1P26436 265 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 HADHAP40939 763 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 CETN2P41208 172 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 TUBB4BP68371 445 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 PDE1BQ01064 536 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 ACY1Q03154 408 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 GPS2Q13227 327 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 TUBB2AQ13885 445 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 FAM69BQ5VUD6 431 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 LCN10Q6JVE6 187 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 TAS2R42Q7RTR8 314 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 KMT5CQ86Y97 462 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 TMEM126BQ8IUX1 230 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 ATG4AQ8WYN0 398 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 FERD3LQ96RJ6 166 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 TUBB2BQ9BVA1 445 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 XKR8Q9H6D3 395 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 KCND3Q9UK17 655 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 POLHQ9Y253 713 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 GSAPA4D1B5 854 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 CFAP99D6REC4 459 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 BTN3A3O00478 584 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 BTN3A1O00481 513 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 ARHGAP6O43182 974 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 SCRG1O75711 98 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 PVRP15151 417 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 CASRP41180 1078 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 ABRQ12979 859 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 PRKG2Q13237 762 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 IL10RAQ13651 578 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 DBN1Q16643 649 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 PARP6Q2NL67 630 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC38Q502W7 563 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 NAPRTQ6XQN6 538 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 ACVR1CQ8NER5 493 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 LCN9Q8WX39 176 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 CCM2Q9BSQ5 444 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 HGH1Q9BTY7 390 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 TRIM55Q9BYV6 548 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-208ENST00000392449 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms