RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC39A3Q9BRY0 314 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SUV39H2Q9H5I1 410 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 GULP1Q9UBP9 304 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 MAGEB17A8MXT2 336 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ECI2O75521 394 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 IFNW1P05000 195 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ITPKBP27987 946 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 GGT5P36269 586 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 HSPB3Q12988 150 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TAF13Q15543 124 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 OR2AG1Q9H205 316 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 AKTIPQ9H8T0 292 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TESMINQ9Y4I5 508 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SNPHO15079 494 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 POU2F1P14859 743 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 MAGP20916 626 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 PLA2G16P53816 162 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 MZT2AQ6P582 158 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 AHSA2Q719I0 299 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 Q9Y3F1 56 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 RASGRP1O95267 797 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC18A2Q05940 514 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TPGS2Q68CL5 300 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SLCO6A1Q86UG4 719 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR65Q8IYL9 337 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF366Q8N895 744 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF599Q96NL3 588 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 C8orf4Q9NR00 106 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 CXCR6O00574 342 aa16.96■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 KAT2AQ92830 837 aa16.96■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 SDK1Q7Z5N4 2213 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC26A3P40879 764 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 ERVK-8P63133 956 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 CYP2U1Q7Z449 544 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 GIPC3Q8TF64 312 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 NSMCE3Q96MG7 304 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 FIZ1Q96SL8 496 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 FBXW2Q9UKT8 454 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 DGKBQ9Y6T7 804 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 CDC7O00311 574 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 PIRO00625 290 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 RGS10O43665 173 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 CASP9P55211 416 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 CDH12P55289 794 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF730Q6ZMV8 503 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 PHTF2Q8N3S3 785 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 LAMP2P13473 410 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 PRKCHP24723 683 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 ADGRE1Q14246 886 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR22Q99680 433 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 PRDM8Q9NQV8 689 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 ERVW-1Q9UQF0 538 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC25A12O75746 678 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 PTPRCAPQ14761 206 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 SNAPC1Q16533 368 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 PYDC2Q56P42 97 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 CARD16Q5EG05 197 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 WDTC1Q8N5D0 677 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 C16orf70Q9BSU1 422 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 SRRDQ9UH36 339 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 SCML2Q9UQR0 700 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAJA2O60884 412 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 CHRNA6Q15825 494 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 NDUFAF6Q330K2 333 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR33Q49SQ1 333 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 LDLRAP1Q5SW96 308 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 FRMD7Q6ZUT3 714 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 TULP3O75386 442 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 SERPINA1P01009 418 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 LCN9Q8WX39 176 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD66B4E2M5 251 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 SAP18O00422 153 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 TRMUO75648 421 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 NT5EP21589 574 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 SEC13P55735 322 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms